FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l02n01 kb2_2_91.3410000000a533.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l02n01 kb2_2_91.3410000000a533.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC39

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TCCTTGATGGGTAGTTTGGCCCTATATTTCTTGATGAGGAACTTCTTAAGC13.3333333333333335No Hit
TACTAAGGGAATCCTTGTTAGTTTCTTTTCCTCCGCTTATTGATATGCTTA13.3333333333333335No Hit
GAATTAAAGGAGACAAGAAAAAGGAAGTTGTTCTAGGACTAAAGGATTAAT13.3333333333333335No Hit
GCATTGATGTTGTTATCGCGTAAATACTTGCTTATCATGTCCGTCTCATAC13.3333333333333335No Hit
CACATATTCAGTTGCCTACTGATGCTTAGGTGGATTTCTCTACTCTTTTAT13.3333333333333335No Hit
AAAGCACAGATTCCAATTGTTCCTCTTTACCATTAGAGCTGTCTCTTATAC13.3333333333333335No Hit
AACCATGAGATTGAGAACGGTGTGTGGAAAAGTAACCTTTTCTCTGTCTCT13.3333333333333335No Hit
CAGCAGACAATGAAAAAAATCAAATACCATTCCTTCTGTCTCTTATACACA13.3333333333333335No Hit
CTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGACTGCTGGCGGAAAATGAGAAAATT13.3333333333333335No Hit
GATTTCTTAGTCATAGACCTCTTAAACTGCTTCCTGTCTCTTATACACATC13.3333333333333335No Hit
AGGTAGATTTGATGCATATGGTTTCTTTCTTGTTGAGAGAGAGAAAGGCTA13.3333333333333335No Hit
GATTTAGACTGCATTTATCAAGCTATATGTGGCTGGCTGTTTTTAAACTGT13.3333333333333335No Hit
AGTAAGGTTTGTCTCCAAGCTCAGATTCAAGAGTCTTGAGTATCTCAATGA13.3333333333333335No Hit
GTAGTAGTTTGTTGTAAGCGTTGTAGCTCTCTCTACCTGTCTCTTATACAC13.3333333333333335No Hit
GCCCTAGAGATAGTTGGAAAAAGGCTGAAGAAGAATAGTGTCTCTCTTGAT13.3333333333333335No Hit
CTTGATGACTGGTTTCATGAGTTTGTCTTCTTCAAGAGCTGTCTCTTATAC13.3333333333333335No Hit
GAGTAACATGTCCTACATCTTCGAAGCTACTATACGAACTGTCTCTTATAC13.3333333333333335No Hit
CTAAAGAAGAACTTCACTTTCTTGGCTAGCTCTTCCTGTCTCTTATACACA13.3333333333333335No Hit
AATCCATTCTGATTTCTTTTGATTGTCCCCGTACTCTGCGATGATCTGTCT13.3333333333333335No Hit
CTCCATCCGGTTGCGCTGTGTGGCCGGAGCCCTGCAACCGATGGAGGTTCT13.3333333333333335No Hit
CTTTTATTGTTTCGTTCATGTGTGTTCGTTTTTGTTATTGAAACCCCTGTC13.3333333333333335No Hit
TCCCAAGAGGGTTCTTCGGTCCTCAACCTCTTATTAATCTGTCTCTTATAC13.3333333333333335No Hit
GATATGGGTTTAGATGCTGTGACTTTGGGGAAAATCACTGGATGTTCACTA13.3333333333333335No Hit
TTTTTTAGCAGAAACAGGAGAAAGATGAGATAGATACCTGTCTCTTATACA13.3333333333333335No Hit
CACCGAATCCTTCTTCTGAATTTCAATAGGTCTTATGTTCTCTTTCCCAGC13.3333333333333335No Hit
ACATATTGCAGGGGAACAAAGAGAGCATTTTGAGAAGTATACGAAAGCAGG13.3333333333333335No Hit
TTTCAGAACTGTGCATGTCATGTAATGTGATACATGGTAAGCTTCAATACT13.3333333333333335No Hit
TCTCTGCTTCTGCTTTAACTGGTTCAGGTGATGCTGGTTTCTCTTCAACAA13.3333333333333335No Hit
AGCCAAGGAACCGTGTACCTTACCCATGATCTGTCTCTTATACACATCTCC13.3333333333333335No Hit
GAAGAAGTACATCTTCACTATTGATGGCGATTGCTTCGTTGCTAAGGATCT13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers