FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l02n01 kb2_2_90.3410000000a526.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l02n01 kb2_2_90.3410000000a526.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC41

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTATATATGTGTGTGTGTGTATGCCTATACCTCATGTACAAAGAAGAGAAG16.666666666666667No Hit
ACAACATCCAGAAAGAATCTACACTTCATCTTGTGTTGAGGCTTAGAGGAG16.666666666666667No Hit
ACATTGAAGATACGTGCGTGAAGTTTCCTTACCGACGAGTTTGATGCTGTC16.666666666666667No Hit
CTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAACC16.666666666666667No Hit
TATCAACGCAGAGTACGGGACGCTCTCTCACTGATCATTCACAATCTCTCT16.666666666666667No Hit
ATGTTAGACTCTCCTATTGGAGTGTCTACTATACGAGCCAATGTCTGCTCA16.666666666666667No Hit
CGACAGGCATGCTCACACTCGAACCCTTCTCAGAAGATCAAGGTCGGTCGG16.666666666666667No Hit
GTCTTGAGATCTTCTCTGTTTATTTGACTTGTCTCTTTTTCTCTCTCTCTG16.666666666666667No Hit
GTATCAACGCAGAGTACGGGGAAGCCGGAAACCTTAAGGTTTTATATCTGG16.666666666666667No Hit
GCAATAAACTTGATAATTCCTCATGTAAAAGGGTCTAGAGCAGATGAAACT16.666666666666667No Hit
TATCAACGCAGAGTACGGGGATTAAAAAGAGAAAACACGTGTAAAGCACCA16.666666666666667No Hit
GAACTACAAGATTCAAACCTCAGACTCTGCTACAGTTCAACCACTTTCTTC16.666666666666667No Hit
TACCAATGATGAGAAGAAGAAGGAAACCTAGTTATAAGAAGACCCTTTTTT16.666666666666667No Hit
CATAAGAAGCTTTCACTTTCACAGTACTTATATGGATATTCGAAAGAAACT16.666666666666667No Hit
AGTAAAGTCTCTGCTTCTTTTGGTGTCAGAAACTGACTTCTCCCAAGTAAA16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.2)