FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l01n01 kb2_4_20.3410000000ae2d.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l01n01 kb2_4_20.3410000000ae2d.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences96
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC39

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GAGATATACAAAGTGAGAGATCAAACCCAACCCCTACGGTTACATCTAAAA11.0416666666666665No Hit
CAATAAGCTAGTGTCATACGCTGACATTCATTTATCCCTGTCTCTTATACA11.0416666666666665No Hit
ACCAGAAGCAGAGAACTGCAATGGAATTGCTTGATCAGTATCTCAACTTTG11.0416666666666665No Hit
ATAGACAAAAGGGAAACAGCCCAGATCATATATTAAGGCTGTCTCTTATAC11.0416666666666665No Hit
GGGTATACCAGTGGTTCCATCGATGACCGTCAGTGGAAGTGCTGTCTCTTA11.0416666666666665No Hit
GAGAGAGAGAATGCAAGAAAAACTCAGAAGGCTAGAAAGGAGGAATATGCT11.0416666666666665No Hit
GAGGAATGTTCTGGAAAGAACAATCGTAGCACTGTCTCTTATACACATCTC11.0416666666666665No Hit
GTACGGGGCTGCAAACACTGAACGTGGTGGGAGTATTATAACTGTCTCTTA11.0416666666666665No Hit
GGGAAGAGCCCAGCTTGAAAATCGGACGTCTTCGGCGTTCGAATTGTAGTC11.0416666666666665No Hit
ATTTCTACCCTTGCATCGTTATTTCGACCGTGTCTGATATCTGTCTCTTAT11.0416666666666665No Hit
GTAATCAGTCGATTGATTTACAGAGTTGAGAGTTTGGTTTTTAGTTAGTTA11.0416666666666665No Hit
GATTAAAACGATACTAGGTGGTACAGGAATATCAACCTGTTATCCATCCTG11.0416666666666665No Hit
GAATGAGTCAATCATCCACTTTGGTATTTTATTGAACAAAAATGGTGATAT11.0416666666666665No Hit
GGATTAAACGGAGGGAGACATTAAAAACAAGAATTAGGGCTGTCTCTTATA11.0416666666666665No Hit
GTCTAAAGTCAATGGCATAAGAAAGAGTACCTTAAGCAAGTACTGTCTCTT11.0416666666666665No Hit
GTCCCAATGTGGCCGGTCACCCTCTCAGGGCCGGCTACCCGTCAAAGCCTT11.0416666666666665No Hit
CTGATACACACCCTAAATTACACACAGCTTTTTTATCTGTCTCTTATATAC11.0416666666666665No Hit
ATCATCAGCAGTATGATCTGCAACAAGAGTTTGAACCAAACTTCAATGGTG11.0416666666666665No Hit
GTTTTTTCCCTTTCTGCTGTCTTTTGAATCTGTCTCTTATACACATCTCCA11.0416666666666665No Hit
GAAATATAGTCACGAACTTCATCTTGTTTTAAGGCTCTCATATCTCTGTCT11.0416666666666665No Hit
AAATAAACGGGTCGATGTGGAAATCTTAGAAGCTGTCTCTTATACACATCT11.0416666666666665No Hit
CTGTTAATCATTACTCCGATCCCGAAGGCCAACACAATAGGATCGAAATCC11.0416666666666665No Hit
CCTTTTCGTTTTCTGGTTTAAAACCCAATGGGGATGGTTCTTTTTTTGGGA11.0416666666666665No Hit
TGATTGTTGTGCCAACTCTCTCCAAATGAAAATACCGATAACCACCAAACA11.0416666666666665No Hit
ACAATATGCTTAGCGGGTTTTCTAGGGAATCTGTTTACGTCCTGTCTCTTA11.0416666666666665No Hit
CTTGAAGATACCGCTGTAAGAAGACTCCTCGAAACCCTTTTAACAAACAAC11.0416666666666665No Hit
AAGTGAAACATCTCAGTAACCTGAGGAAAAGACATCAATAGAGACTGTCTC11.0416666666666665No Hit
GCATAAGAGAAGCAGCAGTCTGAAGAAGTGTCTTGAAAGCCTTGATGAATT11.0416666666666665No Hit
ACCCCAAAGAAAAGGGTGTCTAAAATGTTCACGGTTCCTTCTCTGTGTCTT11.0416666666666665No Hit
AACTTATACAATGCTGTAGAGGCTACTCGTGAGTTAGAAGCCAATTATCGT11.0416666666666665No Hit
GTCCTCCACTTTGTGTTACCAAAGCTTCAACCTGCCCATGGGTAGATCACA11.0416666666666665No Hit
GTATCAACGCAGAGTACGGGGTTGTATAGTCAAGTAATGAAGTGCCTGTCT11.0416666666666665No Hit
GTACTGGAGGGTAGATTGGTCTTTTGTTACTGGGAGAAGGAGAGCTTTGGG11.0416666666666665No Hit
TATCAACGCAGAGTACGGGGCAGTGGTATCAACGCAAAAAAAAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
TCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACGTTCATTAATCTCGTATGCCGT11.0416666666666665No Hit
CATTTATTCTTCCATTTAGTCAGGGAAACATCAGAGCTTATTCAGTCTCAG11.0416666666666665No Hit
GTGGAATGCAATGAAATCGAATGGAGTGGAATCGAATGGAATTGCATGGAA11.0416666666666665No Hit
ACTCTATACATCGTGTTACCACTTATCAGAGTCCTGTGTTTTTAATAAAAC11.0416666666666665No Hit
GCGTTATTGGCTGGACTGTAAAGGAATATTAAATGATGATGATGGTGATGA11.0416666666666665No Hit
CCATAGAAAATCTCAAGTACGCAACAACAAAAGCAAAGAGTATTACTTCAA11.0416666666666665No Hit
CTTCTATTATTAGCATAAGCAAGACGAAAACCATCAGGAGTATAAACTGTC11.0416666666666665No Hit
GTATAGATTCTATCCTCGGAAGAAAACAAGAATAGAAGAAGAACCTCTAAT11.0416666666666665No Hit
GTTTTAACTCTATAAGGAGAGTCACTTTGTAATGAATAATCTGCTTTTTGT11.0416666666666665No Hit
TCGTTAGCCTTATTTATGTTCTATCAGCCTTTAAAAAGGAACAATAAACCA11.0416666666666665No Hit
GGTGTGCCTTGCGCAGATCAACAGGTACATGTATGCATGACACTGCGCAGG11.0416666666666665No Hit
GTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCGGTTATGCGCAC11.0416666666666665No Hit
TATCAACGCAGAGTACGGGAAGTTGACCAAATATCAGTATTAATAAGGGTT11.0416666666666665No Hit
CTTCTGGGTCTTTATTTTTAGACAGGCTTTCCCTCTGTAGCCTCTGTCTCT11.0416666666666665No Hit
AGCAATGACAGGTGATGTGAACATTTACATGAATGATGTGGATGATCCAAA11.0416666666666665No Hit
GATAATTACTGATGAACCACCGAATGATAGGGATCTGTCTCTTATACACAT11.0416666666666665No Hit
CGAATGAATTTGCTACTATCAACTCTTGTTACTGTCTCTTATACACATCCC11.0416666666666665No Hit
GTGATACAGAATGGAATGATCATCGCTCAAGAAATAAAAGTTACGCTAGGG11.0416666666666665No Hit
CTTTTTTCTAGCTTGAGGACTTTTTACAATATTTAACCAATCAAGTGATGC11.0416666666666665No Hit
TCTTTATACTTTTCACCTCCTATAACTTCTCCTCTTCAGACACATTGTATT11.0416666666666665No Hit
CAAAACATCAGAGTAGTATTTTAAAACCTCGTTTACCCCGTACTCTGCGTT11.0416666666666665No Hit
TCTCTGGACTCTCCTTTACTTTTTCTACTGGGTTACTCCTGTCTCTTATAC11.0416666666666665No Hit
TCAAGGAAGCGAATTTGATCCATCTGAAGAAGTTTTCATCCAAGAAGAAGA11.0416666666666665No Hit
CTTAGTAACTAAATCTTCAACTAATGACACAAAAATCTGTCTCTTATACAC11.0416666666666665No Hit
CTATAAGGCTATGATGAGCTCATGTAATTGAAACACCTGATGCTAGAAGTA11.0416666666666665No Hit
GCCCTAATCATCGTGCCTGGCCTGCCGCAGAACCCAGCGTTCGATCTGGAT11.0416666666666665No Hit
CCCTTACACTCCATTATATTCCAATCCATTCTGGTTGTTTCCATTCCATTC11.0416666666666665No Hit
CTATTTGTTCTTCCTCCATAATGGTTTGTCTTTCGTAGTGTTGTGTTACAA11.0416666666666665No Hit
GCTTAGAGGCGTTGGCTACTACTGATTTTTAACATACAAAAAATTGTTGTC11.0416666666666665No Hit
GATCATTATTGCAGTAGCTAAGACAGAAGGGAAGTACCTCATAAACCTCGT11.0416666666666665No Hit
GGATTCTTTGAAAAGAACCACATCCTAGCATTCTAAGCTAGGATGGCCAAG11.0416666666666665No Hit
GTCTCAAAGATTTTAAAACCAAACTACCATTTAACACAGCAATCCTATTAC11.0416666666666665No Hit
TCCTACAGTCGACATTTCTAAATTTTCCACCTTTTTCAGTTTTCCTCGCCA11.0416666666666665No Hit
TTTCTGCTCCCCATGATAACTTACGTTAGCGAATATACGGATTTTCCTGTA11.0416666666666665No Hit
TTATTCATGAGTGACATTGGTGTATTTTGATGCTGTCTCTTATACACATCT11.0416666666666665No Hit
GAGCATAGACTACTTTCATTGCATGAAATGTAATGCTTGTATGTCGCGACT11.0416666666666665No Hit
CAATTGGTATGATTTTAACAGCAGTCATTAGTTCTGTTCTCATACCTGTCT11.0416666666666665No Hit
ATGTGTATCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACGAGAGTTGA11.0416666666666665No Hit
CATTAGCATTCATATTACTCTGAGTCCCACTACCAGTTTGCCAGACAACAA11.0416666666666665No Hit
TTGCAATGCTCTTCTTTTGAAGGTTAACCAACTGTCTCTTATACACGTCTC11.0416666666666665No Hit
GATTGTACCGATCAGGAAAGCAAAAAAAAATGTTATCTGAATTCCTGTCTC11.0416666666666665No Hit
GTAATCAAGTTTGCAACAACATTTATTCACCACCACACATAAGCTGTCTCT11.0416666666666665No Hit
ATTTGTATGTGATTTGCTGGTTTCAGAATTTCTGTTAACAAGACTGGCTAT11.0416666666666665No Hit
CATATGAAAGAACAAAAAAAATCGGACAACAATATGACCTGTCTCTTATAC11.0416666666666665No Hit
CCATTTGCTTGGTAAGTATTCCTTCATCCCTTTATTTTGAGCCAATGTGTG11.0416666666666665No Hit
CCTATCCTGTACAAGCTGTGACGAATTTCAATATCAGACTACAGTAACTGT11.0416666666666665No Hit
GTATCGAAAACATGAGTAGAGAAGTAGTCGATCTGTCTCTTATACACATCT11.0416666666666665No Hit
CAAACTACTACTAAACTTTCAGTTCTTAGAAGAAAATTGGCTGCTAGATTG11.0416666666666665No Hit
CTCTTTCACTCCCCTCCCGGGGTTCTTTTCACCTTTCCCTCACGGTACTAT11.0416666666666665No Hit
ATGATGTAACTAGAGAGGTGACATAAGATCCAGTAAGCAACATTATCTTAA11.0416666666666665No Hit
CCACCACCAATAACCACAAGAGGCTTATTCCTAAAAATCTGTCTCTTATAC11.0416666666666665No Hit
GCTTAAGTGGATGTTTCTCATTTTCCATGATTTTCAGTTTTCTTGCCATAT11.0416666666666665No Hit
TACCTGGAGTCCATGACGGTACTGTAAGAATAAGCACCGGCTAACTACGTG11.0416666666666665No Hit
CAAAAATGGTTTCATATTTAGAAGGTACTTGAAGATTCTTAACCAACTTAA11.0416666666666665No Hit
GGTGTGTCTCCATCCTCTACGCTGGTGTATGGTAGATTGTCTTATACCTGT11.0416666666666665No Hit
AAAAAGTACTCTGCGTTGATACCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCAC11.0416666666666665No Hit
CTTATACACATCTCAGAGCCCACGAGACTACCGCTGATCTCGTATGCCGTC11.0416666666666665No Hit
ATGTATCACAACATGAATACATAGTGTTGTGAGGCTGTCTCTTAACACATC11.0416666666666665No Hit
GAGCAAACTTGAACAATCTCTAGAAATCAATTTGGCAGCTTCTCAGAAAAC11.0416666666666665No Hit
GTGTTTTGAGTTAGAAGATGCTTTTTGATGTTTTGAAATCCTTGTTAACCT11.0416666666666665No Hit
GGAAACTTTAGTCAATCGGTGGACGGGATTCTCACCCGTCTTTCGCTACTC11.0416666666666665No Hit
AGGGATAACAGCGCAATCCTATTCTAGAGTCCATATCAACAATAGGGTTTA11.0416666666666665No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[FAIL]Kmer Content

Kmer graph

SequenceCountPValueObs/Exp MaxMax Obs/Exp Position
TTGCATC50.045.011
GTGTCTG50.045.030
CCGTGTC50.045.028
TGCATCG50.045.012
CGTTATT50.045.017
TCGACCG50.045.024
GATATCT50.045.036
TGTCTGA50.045.031
TGTCTCT50.045.042
TTTCTAC50.045.02
TTATTTC50.045.019
CTCTTAT50.045.045
TTCGACC50.045.023
ACCGTGT50.045.027
CCTTGCA50.045.09
GTCTGAT50.045.032
TGATATC50.045.035
CTGATAT50.045.034
TCTACCC50.045.04
TCTGTCT50.045.040
Produced by FastQC (version 0.11.2)