##FastQC 0.11.2 >>Basic Statistics pass #Measure Value Filename H23V3BCXX l01n01 kb2_3_91.3410000000abb3.fastq.gz File type Conventional base calls Encoding Sanger / Illumina 1.9 Total Sequences 15 Sequences flagged as poor quality 0 Sequence length 51 %GC 39 >>END_MODULE >>Per base sequence quality fail #Base Mean Median Lower Quartile Upper Quartile 10th Percentile 90th Percentile 1 38.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2 38.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3 38.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4 38.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5 38.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6 39.733333333333334 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8 39.46666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9 39.46666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13 39.733333333333334 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 16 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 17 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 18 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 19 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 20 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 21 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 22 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 23 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 24 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 25 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 26 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 27 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 28 39.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 29 39.13333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 30 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 31 38.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 32 39.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 33 39.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 34 39.46666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 35 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 36 39.46666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 37 39.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 38 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 39 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 40 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 41 39.733333333333334 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 42 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 43 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 44 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 45 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 46 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 47 39.733333333333334 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 48 40.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 49 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 50 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 51 39.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 >>END_MODULE >>Per tile sequence quality pass #Tile Base Mean 2102 1 0.0 2102 2 0.0 2102 3 0.0 2102 4 0.0 2102 5 0.0 2102 6 0.0 2102 7 0.0 2102 8 0.0 2102 9 0.0 2102 10 0.0 2102 11 0.0 2102 12 0.0 2102 13 0.0 2102 14 0.0 2102 15 0.0 2102 16 0.0 2102 17 0.0 2102 18 0.0 2102 19 0.0 2102 20 0.0 2102 21 0.0 2102 22 0.0 2102 23 0.0 2102 24 0.0 2102 25 0.0 2102 26 0.0 2102 27 0.0 2102 28 0.0 2102 29 0.0 2102 30 0.0 2102 31 0.0 2102 32 0.0 2102 33 0.0 2102 34 0.0 2102 35 0.0 2102 36 0.0 2102 37 0.0 2102 38 0.0 2102 39 0.0 2102 40 0.0 2102 41 0.0 2102 42 0.0 2102 43 0.0 2102 44 0.0 2102 45 0.0 2102 46 0.0 2102 47 0.0 2102 48 0.0 2102 49 0.0 2102 50 0.0 2102 51 0.0 >>END_MODULE >>Per sequence quality scores pass #Quality Count 39 15.0 >>END_MODULE >>Per base sequence content fail #Base G A T C 1 73.33333333333333 6.666666666666667 0.0 20.0 2 13.333333333333334 46.666666666666664 20.0 20.0 3 26.666666666666668 20.0 40.0 13.333333333333334 4 20.0 20.0 46.666666666666664 13.333333333333334 5 20.0 53.333333333333336 20.0 6.666666666666667 6 26.666666666666668 26.666666666666668 26.666666666666668 20.0 7 46.666666666666664 20.0 26.666666666666668 6.666666666666667 8 26.666666666666668 40.0 20.0 13.333333333333334 9 20.0 20.0 46.666666666666664 13.333333333333334 10 20.0 13.333333333333334 60.0 6.666666666666667 11 20.0 33.33333333333333 33.33333333333333 13.333333333333334 12 20.0 26.666666666666668 53.333333333333336 0.0 13 20.0 20.0 40.0 20.0 14 0.0 33.33333333333333 40.0 26.666666666666668 15 13.333333333333334 26.666666666666668 46.666666666666664 13.333333333333334 16 33.33333333333333 20.0 20.0 26.666666666666668 17 20.0 20.0 60.0 0.0 18 13.333333333333334 6.666666666666667 60.0 20.0 19 13.333333333333334 40.0 26.666666666666668 20.0 20 26.666666666666668 26.666666666666668 26.666666666666668 20.0 21 33.33333333333333 20.0 26.666666666666668 20.0 22 33.33333333333333 20.0 26.666666666666668 20.0 23 6.666666666666667 40.0 33.33333333333333 20.0 24 20.0 6.666666666666667 60.0 13.333333333333334 25 20.0 6.666666666666667 40.0 33.33333333333333 26 6.666666666666667 26.666666666666668 46.666666666666664 20.0 27 20.0 33.33333333333333 20.0 26.666666666666668 28 13.333333333333334 33.33333333333333 46.666666666666664 6.666666666666667 29 20.0 20.0 40.0 20.0 30 20.0 26.666666666666668 40.0 13.333333333333334 31 20.0 26.666666666666668 26.666666666666668 26.666666666666668 32 33.33333333333333 33.33333333333333 26.666666666666668 6.666666666666667 33 13.333333333333334 40.0 26.666666666666668 20.0 34 6.666666666666667 33.33333333333333 46.666666666666664 13.333333333333334 35 20.0 26.666666666666668 33.33333333333333 20.0 36 13.333333333333334 20.0 26.666666666666668 40.0 37 26.666666666666668 20.0 26.666666666666668 26.666666666666668 38 20.0 33.33333333333333 13.333333333333334 33.33333333333333 39 6.666666666666667 26.666666666666668 33.33333333333333 33.33333333333333 40 20.0 33.33333333333333 33.33333333333333 13.333333333333334 41 20.0 26.666666666666668 40.0 13.333333333333334 42 0.0 13.333333333333334 20.0 66.66666666666666 43 13.333333333333334 26.666666666666668 60.0 0.0 44 26.666666666666668 13.333333333333334 20.0 40.0 45 0.0 13.333333333333334 66.66666666666666 20.0 46 6.666666666666667 20.0 20.0 53.333333333333336 47 0.0 26.666666666666668 46.666666666666664 26.666666666666668 48 26.666666666666668 13.333333333333334 33.33333333333333 26.666666666666668 49 13.333333333333334 13.333333333333334 40.0 33.33333333333333 50 13.333333333333334 26.666666666666668 33.33333333333333 26.666666666666668 51 13.333333333333334 66.66666666666666 13.333333333333334 6.666666666666667 >>END_MODULE >>Per sequence GC content fail #GC Content Count 0 0.0 1 0.0 2 0.0 3 0.0 4 0.0 5 0.0 6 0.0 7 0.0 8 0.0 9 0.0 10 0.0 11 0.0 12 0.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 0.0 17 0.0 18 0.0 19 0.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 0.0 24 0.0 25 0.0 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 0.5 31 1.0 32 1.0 33 1.0 34 2.5 35 4.0 36 2.0 37 0.0 38 1.0 39 2.0 40 1.0 41 0.0 42 2.0 43 4.0 44 3.5 45 3.0 46 1.5 47 0.0 48 0.0 49 0.0 50 0.0 51 0.0 52 0.0 53 0.0 54 0.0 55 0.0 56 0.0 57 0.0 58 0.0 59 0.0 60 0.0 61 0.0 62 0.0 63 0.0 64 0.0 65 0.0 66 0.0 67 0.0 68 0.0 69 0.0 70 0.0 71 0.0 72 0.0 73 0.0 74 0.0 75 0.0 76 0.0 77 0.0 78 0.0 79 0.0 80 0.0 81 0.0 82 0.0 83 0.0 84 0.0 85 0.0 86 0.0 87 0.0 88 0.0 89 0.0 90 0.0 91 0.0 92 0.0 93 0.0 94 0.0 95 0.0 96 0.0 97 0.0 98 0.0 99 0.0 100 0.0 >>END_MODULE >>Per base N content pass #Base N-Count 1 0.0 2 0.0 3 0.0 4 0.0 5 0.0 6 0.0 7 0.0 8 0.0 9 0.0 10 0.0 11 0.0 12 0.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 0.0 17 0.0 18 0.0 19 0.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 0.0 24 0.0 25 0.0 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 0.0 31 0.0 32 0.0 33 0.0 34 0.0 35 0.0 36 0.0 37 0.0 38 0.0 39 0.0 40 0.0 41 0.0 42 0.0 43 0.0 44 0.0 45 0.0 46 0.0 47 0.0 48 0.0 49 0.0 50 0.0 51 0.0 >>END_MODULE >>Sequence Length Distribution pass #Length Count 51 15.0 >>END_MODULE >>Sequence Duplication Levels pass #Total Deduplicated Percentage 100.0 #Duplication Level Percentage of deduplicated Percentage of total 1 100.0 100.0 2 0.0 0.0 3 0.0 0.0 4 0.0 0.0 5 0.0 0.0 6 0.0 0.0 7 0.0 0.0 8 0.0 0.0 9 0.0 0.0 >10 0.0 0.0 >50 0.0 0.0 >100 0.0 0.0 >500 0.0 0.0 >1k 0.0 0.0 >5k 0.0 0.0 >10k+ 0.0 0.0 >>END_MODULE >>Overrepresented sequences fail #Sequence Count Percentage Possible Source GCTGATGAATTGTTCATTAGGTATGTGGTGGAAGGAGAAAACACACCCCTT 1 6.666666666666667 No Hit GATGATAGTGATGATGATGATGAGCCTTGAAACATTTTCGGCTGTCTCTTA 1 6.666666666666667 No Hit CTGAAGAAGAAGTCGCTCAAGTCTCTCTTTGGAAAGAGCTTTGCTTTGGGA 1 6.666666666666667 No Hit GAGTGTGAATCTTCAGTTTGAGAATCCTCTTGATGAGAACACAGCAAGGGA 1 6.666666666666667 No Hit GTTTATGTCTTTCTTGATCTCTTCAACATGTGTATCCCTGTCTCTTATACA 1 6.666666666666667 No Hit GGGTGGGTTCTTACTTGGAAGGTTTTGATTCCTCCTCCAATCTTCTTTTCA 1 6.666666666666667 No Hit GGACGATGTGATGATCGTCTTCTTCTTCTTCTTCACACTCATATTCTTCCG 1 6.666666666666667 No Hit CATTTCCACATTCAAATCACAAGTCAATAATAAAACTGCTACTTTGCTCAA 1 6.666666666666667 No Hit GAAACATTGTTTCTTCTCTACAACCGAAAAAGATGAGCTTTATCTCAACTT 1 6.666666666666667 No Hit GTTGAAGCTTGATCTGTTGTAGCGGTAGATCGATCCTTCTCCTGTCTCTTA 1 6.666666666666667 No Hit GAGTAAGCTTCATTAATGTTCCATTAATGCCTCTTTGAAGGAGATCTGTAA 1 6.666666666666667 No Hit GACTAGTAGTAGTAGCAATGGATGTTATTTGTGTTCTCTATTTCACCATCA 1 6.666666666666667 No Hit CCCAAGGATTATATTGTTAGGGATTTGACGAAGAAGAAGACCTGTCTCTTA 1 6.666666666666667 No Hit GCATTCAGAGGAGAATGTACTTCTTCCTGCTATTTCCGCTTCACCAATCAC 1 6.666666666666667 No Hit AATCTCTGTTGAATCTTTCCTCTTGATACAATCTCTCATAGCTATACGAAG 1 6.666666666666667 No Hit >>END_MODULE >>Adapter Content warn #Position Illumina Universal Adapter Illumina Small RNA Adapter Nextera Transposase Sequence 1 0.0 0.0 0.0 2 0.0 0.0 0.0 3 0.0 0.0 0.0 4 0.0 0.0 0.0 5 0.0 0.0 0.0 6 0.0 0.0 0.0 7 0.0 0.0 0.0 8 0.0 0.0 0.0 9 0.0 0.0 0.0 10 0.0 0.0 0.0 11 0.0 0.0 0.0 12 0.0 0.0 0.0 13 0.0 0.0 0.0 14 0.0 0.0 0.0 15 0.0 0.0 0.0 16 0.0 0.0 0.0 17 0.0 0.0 0.0 18 0.0 0.0 0.0 19 0.0 0.0 0.0 20 0.0 0.0 0.0 21 0.0 0.0 0.0 22 0.0 0.0 0.0 23 0.0 0.0 0.0 24 0.0 0.0 0.0 25 0.0 0.0 0.0 26 0.0 0.0 0.0 27 0.0 0.0 0.0 28 0.0 0.0 0.0 29 0.0 0.0 0.0 30 0.0 0.0 0.0 31 0.0 0.0 0.0 32 0.0 0.0 0.0 33 0.0 0.0 0.0 34 0.0 0.0 0.0 35 0.0 0.0 0.0 36 0.0 0.0 0.0 37 0.0 0.0 0.0 38 0.0 0.0 6.666666666666667 39 0.0 0.0 6.666666666666667 >>END_MODULE >>Kmer Content pass >>END_MODULE