FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l01n01 kb2_3_91.3410000000abb3.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l01n01 kb2_3_91.3410000000abb3.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC39

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCTGATGAATTGTTCATTAGGTATGTGGTGGAAGGAGAAAACACACCCCTT16.666666666666667No Hit
GATGATAGTGATGATGATGATGAGCCTTGAAACATTTTCGGCTGTCTCTTA16.666666666666667No Hit
CTGAAGAAGAAGTCGCTCAAGTCTCTCTTTGGAAAGAGCTTTGCTTTGGGA16.666666666666667No Hit
GAGTGTGAATCTTCAGTTTGAGAATCCTCTTGATGAGAACACAGCAAGGGA16.666666666666667No Hit
GTTTATGTCTTTCTTGATCTCTTCAACATGTGTATCCCTGTCTCTTATACA16.666666666666667No Hit
GGGTGGGTTCTTACTTGGAAGGTTTTGATTCCTCCTCCAATCTTCTTTTCA16.666666666666667No Hit
GGACGATGTGATGATCGTCTTCTTCTTCTTCTTCACACTCATATTCTTCCG16.666666666666667No Hit
CATTTCCACATTCAAATCACAAGTCAATAATAAAACTGCTACTTTGCTCAA16.666666666666667No Hit
GAAACATTGTTTCTTCTCTACAACCGAAAAAGATGAGCTTTATCTCAACTT16.666666666666667No Hit
GTTGAAGCTTGATCTGTTGTAGCGGTAGATCGATCCTTCTCCTGTCTCTTA16.666666666666667No Hit
GAGTAAGCTTCATTAATGTTCCATTAATGCCTCTTTGAAGGAGATCTGTAA16.666666666666667No Hit
GACTAGTAGTAGTAGCAATGGATGTTATTTGTGTTCTCTATTTCACCATCA16.666666666666667No Hit
CCCAAGGATTATATTGTTAGGGATTTGACGAAGAAGAAGACCTGTCTCTTA16.666666666666667No Hit
GCATTCAGAGGAGAATGTACTTCTTCCTGCTATTTCCGCTTCACCAATCAC16.666666666666667No Hit
AATCTCTGTTGAATCTTTCCTCTTGATACAATCTCTCATAGCTATACGAAG16.666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.2)