FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l01n01 kb2_3_89.3410000000ab9a.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l01n01 kb2_3_89.3410000000ab9a.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingIllumina 1.3
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC43

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGGAGTAAAGTTAATACCCTG16.666666666666667No Hit
ATTCCGAGAATTGAGCTCCGACGGAGAATAAACGAAGCGGTAACACAAACA16.666666666666667No Hit
ACTTAGATGTTTCAGTTCGCTAAGTTTTCAAAGTCCAAAGAGCGCAGACTA16.666666666666667No Hit
GACCTCCTGGGTCTAGTCAGTAAAATTCTGCAACTCTAGGAATTCTAAGAT16.666666666666667No Hit
CTTGAGACTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAATGAAACCCTGTC16.666666666666667No Hit
CAACTGGGCTCACGAGCAAAAAGTGGTTACTATTTTCAGTGCACCAAACCT16.666666666666667No Hit
ACCGTCGATACAACCATTAAATCTCTTAAGAGCACACAAATTTAGGCGTAC16.666666666666667No Hit
CTAATATACGGATGGTCTTTGTTTCAAGCAAGCCTGTTGACAACTTTGTTG16.666666666666667No Hit
GTGTTGATTATCAGTTGATTGATATCTCTGAAGATGGCTTTGTTAGTCTTC16.666666666666667No Hit
CTGTTAGAGTCTCTCGGATTAAGCAACAACGATGAGTTCCTCCCAATCTTC16.666666666666667No Hit
CTCTCAAATGGAAATCTCATGCATCCTATTTGAAAAGGAATATGACCTGCG16.666666666666667No Hit
CCTCTGCCTCAGCCTCCTCTTCTTCACCTTGGTCTCCTCCAGCTCTGTCTC16.666666666666667No Hit
GTTCACAGTACTGGGAAATAGGAGCACAGTACTCGGAAACTGTCTCTTATA16.666666666666667No Hit
GCTCTAATCATCCTCTGTGGATCAGGAATCCTAGATTTCGAATCAAACGCA16.666666666666667No Hit
GTATAATAGCAACTCAGAGCAGATCTACATAGCACCCATCAACTTCATACA16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.2)