FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l01n01 kb2_3_80.3410000000aaf8.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l01n01 kb2_3_80.3410000000aaf8.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC43

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTATAAGGCAATGGCTGTAACGAAAACACAGAGATGCGTAAGGAAGTTCAC12.083333333333333No Hit
CTATAGTGTTGCCATTAGAATCTAATCTTCTCTTTATGATATCATGTTTCA12.083333333333333No Hit
GTCATGACGGGTACGAAGATGAAGATGAAGATGACATTCCTTTGGTTCTGT12.083333333333333No Hit
CCTGGAAGCTTCTCTTTGATCTTGTCCATAAATCCCTTCTTCTCCTCCGGG12.083333333333333No Hit
TCTCTAGTTTCCTCCTCAATACTCATCTTGTCCTGTCTCTTATACACATCT12.083333333333333No Hit
GTCCAAAACAGAACGACCCGTACTCTGCGTTGATACCCTGTCTCTTATACA12.083333333333333No Hit
CCTTTCGCCTCTGAAAGCGTCCTTCCTTCTCAATGCCCGGGCATCCATCCA12.083333333333333No Hit
GAATGGAAACTTCCGTTATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGC12.083333333333333No Hit
ACAATAAGCTCTGTGGTGTGACTTCCTAGATATTCATACCCTGTCTCTTAT12.083333333333333No Hit
CAAGGAATACTGATCCGGAAGCTACTTAGCTAGATGGATCCAGAAATCTGT12.083333333333333No Hit
CTACTCAGAAGCTCATAGGGGATGAACCAGTTCTCGTTCGAGATTTCATAC12.083333333333333No Hit
CCCTCCTACTCATCGAGGCCTGGCTCTTGCCCCGACGGCCGGGTATAGGTC12.083333333333333No Hit
GAGAATCAGAGTCCATATTCTTACTGATGGTCGTGATGTTTTGGATGGTTC12.083333333333333No Hit
ACTTTAAATTTGCCCACAGAACCCTCTAAATCCCCTTGTAAATTTAACTGT12.083333333333333No Hit
ACCTATACCCGGCCGTCGGGGCAAGAGCCAGGCCTCGATGTGTAGGAGGGC12.083333333333333No Hit
GTTGTGTCTCTCTCTCCCGTACTCTGCGTTGATACCCTGTCTCTTATACAC12.083333333333333No Hit
TATCAACGCAGAGTACGGGGAAGAAGAACTTACAGAGCTCACGGTAGAGTC12.083333333333333No Hit
TTGTAATACCTTACTCCCATAGAGTCAATCTCTTCAATGGAGAAATTGGAG12.083333333333333No Hit
CATCATATCTTTACCAACAAAGCGATAAAATGGGTGGATTATAAGGAGTAC12.083333333333333No Hit
GATATCAACAACTGCCACTTCAATATCTGGACATTTCAATGCAATCACTGC12.083333333333333No Hit
ACCACACACCACTTAGGAGGAAGGTACTGAACATTCTGCGCGTTTACCTGA12.083333333333333No Hit
CGTGAATTCGTGCTGAAATCCCATTCAGCGTTTGTTTTGTCAACCCATTCA12.083333333333333No Hit
TCCTTACTACTTCCGGCTTGTTTCTCTCTGAAGAATCACCGGAAAAAAAAA12.083333333333333No Hit
CCATTCCCACTATTGGGTTCAATGTGGAGACTGTGGAGTACAAGAACATCC12.083333333333333No Hit
GTCCTTTCTAAAGATGGAGACAGAGATTGGCCAAGAAACACACAAGTCTGT12.083333333333333No Hit
TATCAACGCAGAGTACGGGAAAGCAGCTTCTGCAACCTATTCGTTGGTTGG12.083333333333333No Hit
GTAGAGCACTGACAAGGCTCGGGGGCCTACCAGCCTACCAACCCTTATCAC12.083333333333333No Hit
GAATTCGAACCATTCCTTGTAGATCATTTGATTCTCCTTGGAACAAGAACT12.083333333333333No Hit
GCATTAACTAGAGCCTTCACAGTGTAGTCTTTCAAATTGTCCAATACCATT12.083333333333333No Hit
GGATAGACAAGTTCCACTGATGGATGAAATCGACACAAAGGTGGACAGAGC12.083333333333333No Hit
CCTTCATATTCAGCCTTGTGGGAGAAACATTCTTCACGGTCTATCACGAAT12.083333333333333No Hit
GTTCAAGACTGAGGAATACTCTCACACGGCGGTGAACAAGTTCAATGTGAT12.083333333333333No Hit
ACACCAAAGTTGTCATGGTTACCCCTAAGATCATAAAATATGCTCCTGTCT12.083333333333333No Hit
TACTAATACAGAGAGATGATGATGTCCGAGAAAATGTAGTTTCTCATCATC12.083333333333333No Hit
TATCAACGCAGAGTACGGGATCTAACAAAACTTATAAATCAAATCAAAAAT12.083333333333333No Hit
TTTCAAGGGCCGCCGGGGGCGCACCGGACACCACGCGACGTGCGGTGCTCT12.083333333333333No Hit
ATTCGGCAGGTGAGTTGTTACACACTCCTTAGCGGATTTCGACTTCCATGA12.083333333333333No Hit
GGGTTTCATCATAGCGGAGATGTCTGATTAAGTCCCTCTATGCCTGTCTCT12.083333333333333No Hit
GTATCAACGCAGAGTACGGGGACATAGACAAGAAGATCACATTATAAAGAT12.083333333333333No Hit
GTGGTGATTCTTCTTCGTCTTCTTCATCTTCTGATGATGAAGACGAGAAGA12.083333333333333No Hit
ATGCAAAACAATTGTCGGGTATACAGGACGCCTAAATTGCCTGGGGATTGT12.083333333333333No Hit
CTTACAATTCCATCATGAAGTGTGATGTGGATATCAGGAAGGATCCTGTCT12.083333333333333No Hit
GATTCCATCAGCATACGATCCATTTGCAGAAGCTAAAGATTCAGATCTGTC12.083333333333333No Hit
TTCTTGGAGAGTGGATGTCGTAGACTCCTGGACCTGTCTCTTATACACATC12.083333333333333No Hit
CTTATCGATCATGAAGATCAGACTTAGCATAACCATCATACTTTTATCATA12.083333333333333No Hit
TCCATTACCTTATCGTAAGCTTGATGACAATCTCTCTTTAGATTCGTTACC12.083333333333333No Hit
GACCATAACCAGTAATAGCCTCAAAAAGACCTTCCCAGTCATCTCCGTAAT12.083333333333333No Hit
ATCGAATCTCACTCTTTTGGAAACAATGGATCTTACTGAGATCCTTAGGCA12.083333333333333No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.2)