FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l01n01 kb2_2_95.3410000000a576.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l01n01 kb2_2_95.3410000000a576.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC40

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TCGTTATTGTCTGTGGTTACAAAAGAGAACTAAGAAGCAACAATTTTTATT16.666666666666667No Hit
ATAATGCACAACAAAGTGCTAACTAATTAGACTTCTTGCCTTCCAAGATGT16.666666666666667No Hit
GAATGATACTTGTTTACTTGCCACCACCAACTTCCTTGCTGTCTCTTATAC16.666666666666667No Hit
AAGTGTTGTTGCCTAGAGAAATCTACAAGGCCTGTCTATTATACACATCTC16.666666666666667No Hit
GGTATTGTGTGTATCTCTTGACTCTCGTTTGTGTATTGCCTGTCTCTTATA16.666666666666667No Hit
GCACATAATTCTGTAATCTCTGCGATGAAGCCAGGAGTAAACTGGGTGGAT16.666666666666667No Hit
AGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAAAAATTATCTTGATAAAG16.666666666666667No Hit
ATATCAAGAAAGATGAACAACAAGAGTCATTGTCATGAAACCCTGTCTCTT16.666666666666667No Hit
GCCTTAAGCTAAGCAAATTTCAAAGCATTTCAAAAACCCTAGCCTATCTCT16.666666666666667No Hit
GATGATAACTGTGAGGTGATGAATGTTTTGTGTTGTATTCTTGTGTCACTG16.666666666666667No Hit
AAAGTGGTGTTTCACTAGAGACAGGATAAACAGGGCCTTGGAGTACAAATA16.666666666666667No Hit
ACCTATACCCGGCCGTCGGAGCAAGAGCCAGGCCTCGATGAGTAGGAGCTG16.666666666666667No Hit
GAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGAGAGAGTGCATGAGGTTACGATACG16.666666666666667No Hit
ACTTTTGCTTGCGGTCAGTCATCTCTCACACAGGCTGAGCAAGAAAAGGCG16.666666666666667No Hit
GACTTGGAGCAAGGATGGGACTATATGCAGACTGGAATTACTAAGCTGAAA16.666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.2)