FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l01n01 kb2_2_94.3410000000a569.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l01n01 kb2_2_94.3410000000a569.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC40

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTCTAGTAAACAACTTAGGTAAGCGAACACCTAACTTAATCAAGGTAGCAT16.666666666666667No Hit
NTTTAATTGTTTTCATCGGGTAAAGCGAATGACGAGAGGATTTGGGGATGA16.666666666666667No Hit
CCGTTACTAAAGGAATCCTAGTTAGTTTCTTTTCCTCGGCTTAGTTACTGT16.666666666666667No Hit
NCTTTCACTAGTAAAAGATATCCACGCAAGGAAAGAAACTGTCTCTTATAC16.666666666666667No Hit
GTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACGCAGGACGC16.666666666666667No Hit
CCTTTGGATCCAGTGCTTCTTCCATTGACCTTCCTTAGGTTGACATAAATT16.666666666666667No Hit
ATGATATCCTTCTTTTGTCCTGAAATTTCCCTCCATTCTGATTGTTCGTCT16.666666666666667No Hit
GAAGGCTTCTAGTATTTTTGATGAGATGGTTGAAGAAGGTTTGACTCCTAA16.666666666666667No Hit
CCCTGTGAGAACATTTAGAAAAGACATCTATTGACTGTACTTAATCTACAC16.666666666666667No Hit
CTTAATGGGTGTGAGGTGATATCTCATTGTAGTTTGGATTAGTGATGCTGC16.666666666666667No Hit
CCAAGATCTGCACCGACGGCCGCTCCGCCCGGGCTCGCGCCCTAGGTTTTG16.666666666666667No Hit
CTCTGAAAGTTCTTGTTGGAACAAATTCACCTAGTTTATGTCCTACCATAT16.666666666666667No Hit
TTCAAGGAATGTTTATACATCTTGAGCAGCAATAATTCTGTCTCTTATACA16.666666666666667No Hit
GAGTACCCTTACTGATCCTGATCACTAATACTGCTGTCTCTTATACACATC16.666666666666667No Hit
GAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTAAAACCACACCCTACCTTTCTT16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.2)