FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l01n01 kb2_2_89.3410000000a519.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l01n01 kb2_2_89.3410000000a519.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC39

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTATTCAGCACTTTGATCATAAGATGCAAGCATTCCCATGTTCAAAGCCAT14.166666666666666No Hit
ACATTCTACAATGTGAAAAAGCCCAAAGAGAGGAAGGATTTTAAACCTTAC14.166666666666666No Hit
ATCTTATTCCATTATTCCATGCAAGAATATTTAGGCGAAATGCCTGCTTTG14.166666666666666No Hit
GTATATAGGCTGAGCAAGAGAGGGTGACCGTACTCTGCGTTGATACCTGTC14.166666666666666No Hit
TTCCAAACTCTGTATTCAACCTTAGTTCCATCTTCATTCTGAACAGAGATT14.166666666666666No Hit
GAGTACGGGGCAGTGGTATCAACGCAAAAAAAAAAAAAAATATATCCCTTT14.166666666666666No Hit
CTTTTTCTTTCTTCTCTTCCTCTCCAGTGGTCTTGGCGTGATAACCTGGAA14.166666666666666No Hit
CAAGAGAAGGAAAGTTTAAAGCTAGAAATCAATGGAATGTCTCCATTGGAC14.166666666666666No Hit
TAACGAGCTTGATAAGCATGTTTAAGAATTGTCCTTCATCTGTCTCTTATA14.166666666666666No Hit
GGGGATGAGGGTGGAGAAGGTGGAGTTCTTCTACGAGCGTGGAGACTTTCT14.166666666666666No Hit
CTCATGGACTTAGCATCACTGATGCAACCTTTCAAGCTATAACCTGTCTCT14.166666666666666No Hit
GTGTAGTTCTTCATTCTCTGGAAGATAGCTCTGCTAGTGAGAACCTGTCTC14.166666666666666No Hit
AACGTACACCAGACAATATCCAACAAGAACTTGAACTGTGTAATCACTTGT14.166666666666666No Hit
GTCTTAACATGGTCTCATGAAATAAAAGACACAGAGATCTCCTCAACAGAA14.166666666666666No Hit
GCTGAAGGAACTCGGCAAAATAACTCCGTAACTTCAGGATAAGGAGTGCCT14.166666666666666No Hit
ATTCCATTCCATTCCATTCCATTTCGTTCCATTCCATTCCTGTCTCTTATA14.166666666666666No Hit
GTCAGTGTGTTACTTCTTTCTTATCTAAATCTTCCGTACCTGTCTCTTATA14.166666666666666No Hit
GTAGTAACACTGATCATTCTGAAGAAGACCAGAGTAAACCCTGTCTCTTAT14.166666666666666No Hit
CCATAGTAGAAACCCAAGGAGCAAAATTAGCACCCCAATCACTGTCTCTTA14.166666666666666No Hit
GTTATCGCTTGTTCAGTCACATCTAACGAAGCTAGTCACTTGAATTCTCAG14.166666666666666No Hit
AGATGAAGTTAAGAATGCTGACAAGTTTGATGTTGTTCAAGAAAGTATGGA14.166666666666666No Hit
AGATGTATCCATCTGAATGCAATGAAGAAAACCACCATTACCAGCATTAAC14.166666666666666No Hit
AAATTATCTTAAAGTGAACGACTCAGTGGCATTTTGAACATTCTCAGTGTT14.166666666666666No Hit
GAGTACGGGTTCTCGCAAATAAACTACTTCCTCTATATGACTGCTGTCTCT14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.2)