##FastQC 0.11.2 >>Basic Statistics pass #Measure Value Filename H23V3BCXX l01n01 kb2_2_80.3410000000a477.fastq.gz File type Conventional base calls Encoding Sanger / Illumina 1.9 Total Sequences 15 Sequences flagged as poor quality 0 Sequence length 51 %GC 37 >>END_MODULE >>Per base sequence quality fail #Base Mean Median Lower Quartile Upper Quartile 10th Percentile 90th Percentile 1 37.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2 37.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3 37.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4 37.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5 37.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6 39.333333333333336 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7 37.93333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8 37.266666666666666 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9 36.666666666666664 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10 37.733333333333334 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11 39.333333333333336 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12 39.333333333333336 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13 39.46666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14 39.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15 39.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 16 39.333333333333336 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 17 39.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 18 38.06666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 19 38.06666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 20 39.06666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 21 39.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 22 39.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 23 39.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 24 39.333333333333336 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 25 38.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 26 39.333333333333336 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 27 39.46666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 28 39.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 29 39.46666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 30 39.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 31 39.06666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 32 39.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 33 39.46666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 34 39.06666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 35 39.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 36 39.46666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 37 39.46666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 38 39.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 39 39.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 40 39.733333333333334 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 41 38.93333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 42 39.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 43 37.93333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 44 37.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 45 39.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 46 37.93333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 47 37.666666666666664 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 48 37.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 49 38.733333333333334 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 50 38.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 51 37.266666666666666 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 >>END_MODULE >>Per tile sequence quality pass #Tile Base Mean 1211 1 0.0 1211 2 0.0 1211 3 0.0 1211 4 0.0 1211 5 0.0 1211 6 0.0 1211 7 0.0 1211 8 0.0 1211 9 0.0 1211 10 0.0 1211 11 0.0 1211 12 0.0 1211 13 0.0 1211 14 0.0 1211 15 0.0 1211 16 0.0 1211 17 0.0 1211 18 0.0 1211 19 0.0 1211 20 0.0 1211 21 0.0 1211 22 0.0 1211 23 0.0 1211 24 0.0 1211 25 0.0 1211 26 0.0 1211 27 0.0 1211 28 0.0 1211 29 0.0 1211 30 0.0 1211 31 0.0 1211 32 0.0 1211 33 0.0 1211 34 0.0 1211 35 0.0 1211 36 0.0 1211 37 0.0 1211 38 0.0 1211 39 0.0 1211 40 0.0 1211 41 0.0 1211 42 0.0 1211 43 0.0 1211 44 0.0 1211 45 0.0 1211 46 0.0 1211 47 0.0 1211 48 0.0 1211 49 0.0 1211 50 0.0 1211 51 0.0 >>END_MODULE >>Per sequence quality scores pass #Quality Count 31 1.0 32 0.0 33 0.0 34 0.0 35 0.0 36 0.0 37 1.0 38 2.0 39 11.0 >>END_MODULE >>Per base sequence content fail #Base G A T C 1 53.333333333333336 6.666666666666667 6.666666666666667 33.33333333333333 2 13.333333333333334 40.0 40.0 6.666666666666667 3 26.666666666666668 40.0 20.0 13.333333333333334 4 6.666666666666667 20.0 33.33333333333333 40.0 5 20.0 33.33333333333333 46.666666666666664 0.0 6 33.33333333333333 33.33333333333333 33.33333333333333 0.0 7 20.0 20.0 53.333333333333336 6.666666666666667 8 13.333333333333334 40.0 33.33333333333333 13.333333333333334 9 33.33333333333333 26.666666666666668 20.0 20.0 10 13.333333333333334 40.0 20.0 26.666666666666668 11 40.0 20.0 6.666666666666667 33.33333333333333 12 26.666666666666668 33.33333333333333 40.0 0.0 13 26.666666666666668 33.33333333333333 26.666666666666668 13.333333333333334 14 0.0 40.0 33.33333333333333 26.666666666666668 15 26.666666666666668 26.666666666666668 46.666666666666664 0.0 16 0.0 40.0 33.33333333333333 26.666666666666668 17 20.0 26.666666666666668 20.0 33.33333333333333 18 26.666666666666668 26.666666666666668 33.33333333333333 13.333333333333334 19 26.666666666666668 26.666666666666668 33.33333333333333 13.333333333333334 20 13.333333333333334 33.33333333333333 26.666666666666668 26.666666666666668 21 33.33333333333333 26.666666666666668 26.666666666666668 13.333333333333334 22 13.333333333333334 60.0 20.0 6.666666666666667 23 20.0 26.666666666666668 33.33333333333333 20.0 24 20.0 46.666666666666664 33.33333333333333 0.0 25 20.0 46.666666666666664 13.333333333333334 20.0 26 13.333333333333334 46.666666666666664 20.0 20.0 27 33.33333333333333 46.666666666666664 13.333333333333334 6.666666666666667 28 26.666666666666668 40.0 13.333333333333334 20.0 29 13.333333333333334 60.0 0.0 26.666666666666668 30 13.333333333333334 33.33333333333333 26.666666666666668 26.666666666666668 31 20.0 33.33333333333333 40.0 6.666666666666667 32 13.333333333333334 40.0 13.333333333333334 33.33333333333333 33 26.666666666666668 26.666666666666668 26.666666666666668 20.0 34 20.0 40.0 13.333333333333334 26.666666666666668 35 13.333333333333334 60.0 13.333333333333334 13.333333333333334 36 26.666666666666668 13.333333333333334 33.33333333333333 26.666666666666668 37 0.0 46.666666666666664 33.33333333333333 20.0 38 26.666666666666668 20.0 33.33333333333333 20.0 39 6.666666666666667 26.666666666666668 53.333333333333336 13.333333333333334 40 26.666666666666668 33.33333333333333 33.33333333333333 6.666666666666667 41 13.333333333333334 33.33333333333333 20.0 33.33333333333333 42 6.666666666666667 33.33333333333333 26.666666666666668 33.33333333333333 43 20.0 40.0 26.666666666666668 13.333333333333334 44 33.33333333333333 26.666666666666668 6.666666666666667 33.33333333333333 45 26.666666666666668 46.666666666666664 6.666666666666667 20.0 46 13.333333333333334 33.33333333333333 33.33333333333333 20.0 47 20.0 33.33333333333333 33.33333333333333 13.333333333333334 48 6.666666666666667 53.333333333333336 40.0 0.0 49 13.333333333333334 46.666666666666664 20.0 20.0 50 13.333333333333334 13.333333333333334 53.333333333333336 20.0 51 13.333333333333334 26.666666666666668 33.33333333333333 26.666666666666668 >>END_MODULE >>Per sequence GC content fail #GC Content Count 0 0.0 1 0.0 2 0.0 3 0.0 4 0.0 5 0.0 6 0.0 7 0.0 8 0.0 9 0.0 10 0.0 11 0.0 12 0.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 0.0 17 0.0 18 0.0 19 0.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 0.5 24 1.0 25 0.5 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 0.5 31 1.0 32 0.5 33 0.0 34 0.5 35 1.0 36 2.5 37 4.0 38 4.0 39 4.0 40 2.5 41 1.0 42 1.5 43 2.0 44 1.5 45 1.0 46 0.5 47 0.0 48 0.0 49 0.0 50 0.0 51 0.0 52 0.0 53 0.0 54 0.0 55 0.0 56 0.0 57 0.0 58 0.0 59 0.0 60 0.0 61 0.0 62 0.0 63 0.0 64 0.0 65 0.0 66 0.0 67 0.0 68 0.0 69 0.0 70 0.0 71 0.0 72 0.0 73 0.0 74 0.0 75 0.0 76 0.0 77 0.0 78 0.0 79 0.0 80 0.0 81 0.0 82 0.0 83 0.0 84 0.0 85 0.0 86 0.0 87 0.0 88 0.0 89 0.0 90 0.0 91 0.0 92 0.0 93 0.0 94 0.0 95 0.0 96 0.0 97 0.0 98 0.0 99 0.0 100 0.0 >>END_MODULE >>Per base N content pass #Base N-Count 1 0.0 2 0.0 3 0.0 4 0.0 5 0.0 6 0.0 7 0.0 8 0.0 9 0.0 10 0.0 11 0.0 12 0.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 0.0 17 0.0 18 0.0 19 0.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 0.0 24 0.0 25 0.0 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 0.0 31 0.0 32 0.0 33 0.0 34 0.0 35 0.0 36 0.0 37 0.0 38 0.0 39 0.0 40 0.0 41 0.0 42 0.0 43 0.0 44 0.0 45 0.0 46 0.0 47 0.0 48 0.0 49 0.0 50 0.0 51 0.0 >>END_MODULE >>Sequence Length Distribution pass #Length Count 51 15.0 >>END_MODULE >>Sequence Duplication Levels pass #Total Deduplicated Percentage 100.0 #Duplication Level Percentage of deduplicated Percentage of total 1 100.0 100.0 2 0.0 0.0 3 0.0 0.0 4 0.0 0.0 5 0.0 0.0 6 0.0 0.0 7 0.0 0.0 8 0.0 0.0 9 0.0 0.0 >10 0.0 0.0 >50 0.0 0.0 >100 0.0 0.0 >500 0.0 0.0 >1k 0.0 0.0 >5k 0.0 0.0 >10k+ 0.0 0.0 >>END_MODULE >>Overrepresented sequences fail #Sequence Count Percentage Possible Source CAAATATATACGGTTATGTGTACAACAACCACAATGTCTCATTAGTTAAGA 1 6.666666666666667 No Hit CTCGTGTACCCTCAAATCATCAGTTATAGTTCCAACCAAGACGGCAATCTT 1 6.666666666666667 No Hit GTGCTGATGGATACATCTTGGAAGGTAAAGAGTTGGAGTTCTACATGAAGA 1 6.666666666666667 No Hit CGACATTGACAGTTTCGAATGATACTCCCTTCTCCACCTGTCTCTTATACA 1 6.666666666666667 No Hit GAGAAGCTGAGTATTAACAACAAAGGGGAAGAAAACTGTATCCACATTTCT 1 6.666666666666667 No Hit GTACGGGTGGTATCAACGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACTT 1 6.666666666666667 No Hit CCTTAATCTCCTGAATCTGAGCTTCTAAACTCCAATATCAGCATATGACTC 1 6.666666666666667 No Hit GTCTTAACATGGTCTCATGAAATAAAAGACACAGAGATCTCCTCAACAGAA 1 6.666666666666667 No Hit TATCATTACAGAGAGAGATTATCTACGGAAGATCATTGTGCAAGGGAGATC 1 6.666666666666667 No Hit GATCTTTGCTCTGTTTCTGCTTTTGCGTATTTTCCTAATTAAGCACCTGTC 1 6.666666666666667 No Hit AAATGTGATAGAATTTCAGCTGAGAAAAGAGAGAACACTGCGAAGCTTATG 1 6.666666666666667 No Hit CTGTGATAGCGAAAGCATCTGTTGTAATCTAAGGTTCTGTAATGGAGAAAT 1 6.666666666666667 No Hit GGATTATTATCATCGAGGTCAGCTCGGCACTTGGACTTAAGAACAGATTCC 1 6.666666666666667 No Hit GTACTTGAGAGGAATTAATCTAGAAATCCACGGTGTTGAATTCGACAAATT 1 6.666666666666667 No Hit GAGAAGATAAATCAGCTGAAGAGAAAGGAGTACCAGATTTCTGGCTTATTG 1 6.666666666666667 No Hit >>END_MODULE >>Adapter Content warn #Position Illumina Universal Adapter Illumina Small RNA Adapter Nextera Transposase Sequence 1 0.0 0.0 0.0 2 0.0 0.0 0.0 3 0.0 0.0 0.0 4 0.0 0.0 0.0 5 0.0 0.0 0.0 6 0.0 0.0 0.0 7 0.0 0.0 0.0 8 0.0 0.0 0.0 9 0.0 0.0 0.0 10 0.0 0.0 0.0 11 0.0 0.0 0.0 12 0.0 0.0 0.0 13 0.0 0.0 0.0 14 0.0 0.0 0.0 15 0.0 0.0 0.0 16 0.0 0.0 0.0 17 0.0 0.0 0.0 18 0.0 0.0 0.0 19 0.0 0.0 0.0 20 0.0 0.0 0.0 21 0.0 0.0 0.0 22 0.0 0.0 0.0 23 0.0 0.0 0.0 24 0.0 0.0 0.0 25 0.0 0.0 0.0 26 0.0 0.0 0.0 27 0.0 0.0 0.0 28 0.0 0.0 0.0 29 0.0 0.0 0.0 30 0.0 0.0 0.0 31 0.0 0.0 0.0 32 0.0 0.0 0.0 33 0.0 0.0 0.0 34 0.0 0.0 0.0 35 0.0 0.0 0.0 36 0.0 0.0 0.0 37 0.0 0.0 0.0 38 0.0 0.0 6.666666666666667 39 0.0 0.0 6.666666666666667 >>END_MODULE >>Kmer Content pass >>END_MODULE