FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l01n01 kb2_2_75.3410000000a427.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l01n01 kb2_2_75.3410000000a427.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC37

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACCAAAGGTTCAACCAAAATTAACTCATGAAGGATTATAACTGTCTCTTAT12.083333333333333No Hit
GATTTAGATTCTTTCCTTACGCCTGATTTCTACAGCGAGTTAAATGATTGC12.083333333333333No Hit
GTTCAAGATCATCTCTCAGCTTCATGTCAAGAGCATTGGAGACAACTTGAG12.083333333333333No Hit
CCATAATGGGAGTTTCAAAGAAATACCACAAGCTAATCCAAAAACATAGTT12.083333333333333No Hit
CTTCAAAGTCTTTGTTGATTCCTGCTATCTCTGCAGGCTTCAACTGAGGGA12.083333333333333No Hit
ATTTTATGCAGACATATATTGGGATCTTTTATCATGTTCTTTTACATCGAA12.083333333333333No Hit
CTCGCGCTTACTAGGAATTCCTCGTTGAAGACCAACAATTGCAATGATCCT12.083333333333333No Hit
GTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTGTTACCCCACCCGACTCTT12.083333333333333No Hit
GACCTGAACTTGTTATGAAATCGATTGTTCCTGTTGTCATGGCTGGTGTGT12.083333333333333No Hit
CCAAAAATCATTGTGTTGCTACTAGTTTTACTGTGTTGAGTCTGTCTCTTA12.083333333333333No Hit
CTAGGAATGTTATCAGGAATAGTACTTCAGATCTTCTATGGTTTACTAGGA12.083333333333333No Hit
ATCTTATCCATAAACCCTTTCTTCTCTTCTTCCTCTGGTTCTGTCTCTTAT12.083333333333333No Hit
GAACAAAGAAAAACAACAAACATACCCCCAAAAAAGCCTCGAATCCAAAGA12.083333333333333No Hit
CTACAGAAACATGAGTAGTACTCAAATCAGAAACCAAGAACTAACCATTCA12.083333333333333No Hit
TCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTAGATCCTATCTCGTATGCCGT12.083333333333333No Hit
GTCAAAAAGGTTACCACAACACGAAATCCTTACTATCCAGAATCTTAAATA12.083333333333333No Hit
GACTACAACATCCAGAAAGAATCTACACTTCATCTTGTGTTGAGGCTTAGA12.083333333333333No Hit
GAAATTGGTTGTAAGAGAGATCAAGATATTCGATAGTGTTGACGGTCAAGT12.083333333333333No Hit
GAATTGGAGTTAACTCCATTCCCGCTATTGAAGAAGTTAACATCTTTAACT12.083333333333333No Hit
GGAGTGGAGATGTAGTATAATCCTTGGATGTAATGTAAATCTTCAGAATAT12.083333333333333No Hit
GATAACATCCACGAAGTGTCAATATCAAGCGGCGGCTTCGAAGCCGAAGTG12.083333333333333No Hit
AATACAGAGATACAAACAAACACAACACAAACGTCAGAAGATATTATGTAG12.083333333333333No Hit
CTTGAAAGAATCTCATGAAGTTCCAAGAAAACTTAGAAGTGCAACCTGTCT12.083333333333333No Hit
GTCAAGATCTCTCTCTGTCTCTGTAGTGTATCTTCTGCTTTCTCTACTTCT12.083333333333333No Hit
GGTGAAGACGGTGAGAAGAAGAAGAAGGAGAAAAAGAAGAAGATTGTTGAA12.083333333333333No Hit
AACTTAGAAACAGCCATAGAGAAAAAACAAAAGGCTTTCAATTTCAGAAAG12.083333333333333No Hit
CAAATGGAGAGATGCTACAAAATGTGGTGATCATGTGATTTGATACAATTT12.083333333333333No Hit
TATAACAAAAAGGAAATGCAACAAAACAGAAGAAACAACTAAGTAGCTGTC12.083333333333333No Hit
CTTCCTATCATTGTGAAGCAGAATTCACCAAGTGTTGGATCTGTCTCTTAT12.083333333333333No Hit
GAAACAAAACAACTCAAGCTTCTATTACGTAATCTGTTTCCGCGATTATCT12.083333333333333No Hit
CACTTTATCTTTCATTGCCTTATATTGTGCGTTTCTCATCTTATTTCTCAG12.083333333333333No Hit
AGTAAAGAGATAGATTGATTGATGGACTTGTGATGAGTGAATAAAACAGGG12.083333333333333No Hit
GCGTAAGATCTTTCTTCATCGCGTCTCACTATATCAGTCTTGAGCCTGTCT12.083333333333333No Hit
CTACAGTATAAGGGAAAAAAAGAGACAAGTCAGAAGAGAAGAAAGTGATGA12.083333333333333No Hit
ATCAGGGACAATAACGATGAACTAATGGGTGCTGTGTATCTACACTGTCTC12.083333333333333No Hit
GATTTAGAGTTAAACCAGTTTGTATCTAACTATCCAAGGAATTTACACTGT12.083333333333333No Hit
CATACGAAGAGTTCAAAAACGTATAATCCTCAACAGCTGTCTCTTATACAC12.083333333333333No Hit
GTTCGCTATCGGTCTCTCGCCAATATTTAGCTTTAGATGGAGTTTACCACC12.083333333333333No Hit
GATTAACTCGTGCTGGTTCTGTTATTCTTGCCCTTCATGCTCTGTCTCTTA12.083333333333333No Hit
CAACTTAGGTGAGTATATATAGCCTAAGAGAGCAGATGTGAGAAGAAACAT12.083333333333333No Hit
GAAGCTTTCTTCTCGCAGTTTGGAACAGTTAAGAGAGTTAGAGTCTGTCTC12.083333333333333No Hit
CAATGAAATGGTTAAGAAGCTAGAGAGTAAACAGATTCTGTCTCTTATACA12.083333333333333No Hit
GTAGTGGATAACTCCTTCATGTTTGCATCTATAAGAGGACTGTCTCTTATA12.083333333333333No Hit
TTTTTGTACTCTGCGTTGATACCACCCGTACTCTGCGTTGATACTGTCTCT12.083333333333333No Hit
TCATTCAGCCACTCTCCAAAACGCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGATAATTC12.083333333333333No Hit
TCCAGGACGTGGTGATGAATCTTGAGGTGTTCCAACATTAGATTCGTTGTA12.083333333333333No Hit
GTTTTATTATTGCGAACTTTTTTAGGGTGTATGGATAGATACCTGTCTCTT12.083333333333333No Hit
CAAAAACAATCTCATTGAAATTTGATGTCTCGAAAAGCTTTATTTCGAAGC12.083333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.2)