FastQCFastQC Report
Mon 6 Jun 2016
C8CR7ACXX_l02n01_wt2.351000000579b8.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameC8CR7ACXX_l02n01_wt2.351000000579b8.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences150
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC68

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[FAIL]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTGGTCCCTCCGCCCCCTATCCTCTTTCGCCGTGCCGCTCTCCCGTTGTCT10.6666666666666667No Hit
TGCGTCTCTTTCTGTCGGCTGCCCGGTCGTCTCGTCCCTCCTGTGCTCTTC10.6666666666666667No Hit
CGGCCTGTGGCCGCCTCGTCCCCTTTTCCTCAGCCTCTGTGNTGCTCTGCC10.6666666666666667No Hit
CGTCGCTGTCCTCCCCCCTCTTCTTGTCCTCGCTCTGCCCCNCTCCCGTGG10.6666666666666667No Hit
CTCCCTCTCTGCCCGTCCTGCTCGCCCTCCTCCGCTGCCGACCCTGCTCCC10.6666666666666667No Hit
TTCCTGGCTGCCGCCCTCCCCCCCTGTTCTCTCTTCTCTCCTTCCGCTCCC10.6666666666666667No Hit
CTCTGCCTGCCCCCTCCCGCTCCTTTTTCCTCATCTGCTTCNATCTCTCTC10.6666666666666667No Hit
TGTTCTGTTTCGCCCTCCCTCTTGTCCCTGCCCCCTCCTCTGTTTCCTCGT10.6666666666666667No Hit
TTCTCCCCCCTCCGCCCCTCCGCTTCTCCTGCTTTTGCCTCTCTTTCCCAC10.6666666666666667No Hit
TTCCCCGCGCCCGCCCTCTCTGTTCCCCCTTCTTCTCGTGTCCTCTTTGTC10.6666666666666667No Hit
TCTTGCTTTTCTCCCGTCGGCTCCCTGTGGTTCCCCTCGTTGCCTCTCCGT10.6666666666666667No Hit
TTCGGCGTCTTCCCCTCTTCGTTGTTCGCTTGCCCCGCCTCCTCGCTGTTC10.6666666666666667No Hit
TTTCCTGTTCTGCTTCGCCCTCCCTCTTGTCCTCGCCCCTTCCCCTTCTTC10.6666666666666667No Hit
CTCCTCCTTTGCCTCCCCCCGCCACTCTGCTCCTTTTCTCCTTCCTTCCTC10.6666666666666667No Hit
GTCTTCCCCCCCCTCCTTTTCCTCTGCCTGCCACCCTCCTTNTGTCTTTTG10.6666666666666667No Hit
GCGCCGGCCGCCCCCCCGCCGCCCCCCCGCGCCCCCGCGCCCGCCCCGCTG10.6666666666666667No Hit
TTCCTCCCCTGTCCCCTTGCCCCTCCCTCTGTATGCCACCTNCCGCCCCCC10.6666666666666667No Hit
CCGGCGTGTCTCCGCCTGCTGCCCTCTCACTTCGTCTCCCCCCCTCCGCCC10.6666666666666667No Hit
GTCCCTGCCCCCCCCCTCCCCTCTCTGTCTGCCCCCCCCTCCTTTTCCTCT10.6666666666666667No Hit
GCGCCCTCGCTCGTTGCCGCTCTCCCGTGCTCCCCCTCCGCTCCCCGGCCC10.6666666666666667No Hit
CTCCGCCCACTCGGCCGCTCCTCTTCCCGGCATCCCGTTGCNTTCTTGCTG10.6666666666666667No Hit
TGCCCTTTGTGCCCCCTTCCCTTTTCCTCTCCGTTCCGTTGCCTGTCCTCT10.6666666666666667No Hit
CGGCTCCTTCCTCCCCCTCTCTGCCGCCTCCGCTGTCCTCGGCTTGCTCCC10.6666666666666667No Hit
TCCGCCCCTGCCCCGCGCGCTGCGCCCCTCCCGCTCCCTGTTCCCGTCGCC10.6666666666666667No Hit
CCTTCTCTGCGTCTCTTTCTGTCGGCTGCCCGGTCGTCTCGTCCGTCCTGT10.6666666666666667No Hit
TGTCTTCCCCCCCATCCTTCTCCTCTCGCTGCCCCTCCTCCTTAGTCTTTT10.6666666666666667No Hit
GCCTGCCCCCTCCCGCCTCCCTTTCCTGTTCTGTTTCCCCCTCCCTCTTGT10.6666666666666667No Hit
CTGCCTCCCCTGTTGTTGCTGTTGTCGCTGACTTTGGGTTCTCCGTTGCTG10.6666666666666667No Hit
TGGCGCCGGTCCGGCTTCCCTCCTCTTCTCCGGCCTCACTCNCGTCCGCGC10.6666666666666667No Hit
TGCCCTTCTCCCCGGGTTGCGCTCTGTCCCGTCTCTCCCCCCCGCGGGTCT10.6666666666666667No Hit
GCGCCCCTCCCTCTCCTTGTTCCCGTTGCCCCTCTCTCCGCGCCGTCCCTC10.6666666666666667No Hit
TTCTGCCTCGTCCTTCCCTCGCTCTCCGCCCTCCCTCTTTTTCTGCGCTCT10.6666666666666667No Hit
TCCGGCCCCCGTGTCCCTGTTCGTCCCGGTTTCCCCCGCCCTCGCCCTTGC10.6666666666666667No Hit
CCCGCTCTTTCCTTGTCCGCTCTTGGTCGGGTTGTGTCGCCCTTCTTCCCG10.6666666666666667No Hit
CTTCCCCGCCGCCCCCCTATCACCTTACCCGGCTCTACCCGGCTCCCGCCC10.6666666666666667No Hit
CCCCCTCCTGTTCCTCTGCCTGCCCCCCTCCCGTTGTCTTTNCCCCCCTCT10.6666666666666667No Hit
CCGCCCTCTCGTCCTTTTCTCCCCCGTCTGTCCGCGCTGCTCTCCGCCGGC10.6666666666666667No Hit
CTCCCCCCCCCTTGTTCTGGCTATCGTCTGCTGTCTTNACCGTGCACGCAC10.6666666666666667No Hit
TCTCTTTCTGGCGGCTGCCCGGTCGTCTCGTGCCTCCTGCGCACTTCTCCC10.6666666666666667No Hit
GTTCCCGTCGCCCCTCTCTCTGCGTGTTGCCTTTCTCTCTCTCTCCCTGCG10.6666666666666667No Hit
CCTCTCTCTGCGTGTCTCCTGGCTCTCTCTCTGCCTGCGCCGCCCGCCCTT10.6666666666666667No Hit
CGTCTGTCGCTCCTGTTTGTGCCTTTTGTTTCCCCTGCCTCTGCCGGTGTC10.6666666666666667No Hit
CTGTCTTCCCCCCCCTCCTTTTCCTCTGCCTGCCCCCCTCCCTTTGTCTTT10.6666666666666667No Hit
TTCCCCCCCCCGTCCCGGCCCCGCTTTCCGTCCTGCCTCTTGTCCCGTCCC10.6666666666666667No Hit
CTCTGTTCCGCGCGTGCGTCCCTGGGCTTTCTGTCGCATCGNTTCGGCTCG10.6666666666666667No Hit
CGCTTTCTGCCCCCGGCCGCTTTCCCTCTCCATCCCCCCGTNTGTGGCGTC10.6666666666666667No Hit
TTTGTCTTTTGCCCCCTCTCTTCCTCCCCTGTTCCCTTGCCNCTCCCTCTG10.6666666666666667No Hit
CCCTCCCCTCTCTGTCTTCCCCCCCCTCCTTTTCCTCTGCCTGCCCCCCTC10.6666666666666667No Hit
CCCTCCCCTCTCCGTCTTCCCCCTCCTCCTTGTCCTCTGTCNCCCCCCCTC10.6666666666666667No Hit
CCTCTCTTCCTCCCCTGTCCCCTTGCCCCTCCCTCTGCCTGCCCCCTCCCG10.6666666666666667No Hit
CTGCCCGGTCGTCTCGTCCCTCCTGCGCTCTTATCTCAGTCNATGCGGGGG10.6666666666666667No Hit
CTCTGCCGGCTGTTTGCCGTTCTGGTGCTTCGACTCCCCCGCTTCCGCCGC10.6666666666666667No Hit
CCCTCTCTGTCTTCCCCCCCCTCCTTTTCCTCTGCCTACCCCCCTCCCTTT10.6666666666666667No Hit
TCGCCCTCCCTCTTGTCCCTGCCCCCTCCCCATTTTCCTCGNCTCCCGCTT10.6666666666666667No Hit
TCCCGCCCCCCTTTCCTGTTCTGTTGCGCTCGACCTCTTGTNCCTGCCCCC10.6666666666666667No Hit
CCTCCTCCCTCTCTTCCCGTCCTTCGCGCCCGCCTCCCGTGCCGGCCCTGC10.6666666666666667No Hit
CCCCCCCTCCTCCCACTCGATCCGTTCTTTTCACCTGTCACNCGGGCCGGC10.6666666666666667No Hit
TCTTGTCCCTGCCCCCTCCCTTGCTTCCTCGCCTGTCCCCTTGGCCGCCCC10.6666666666666667No Hit
CCGGCCCTGCCCCCCCCCTCCCCTCTCTGTCTTCCCCCCCCTCCTTTTCCT10.6666666666666667No Hit
TGCTGCGGGCCCCCCTGTGCCCTCTTTTCCTGCTTCTCCCTCCTGTCCCGC10.6666666666666667No Hit
TCCCCCCTGTCCCTCCTCCCCTCTTCGGTGGCGCCGCGCCCNCGCCGCCCC10.6666666666666667No Hit
TGTTGCCCGTTTTTCCTCTTTTCCCCTTTCCCCTTCCGCCCCTTCTTGTTT10.6666666666666667No Hit
CTGTCCTCGGTTCCTCTCCGGCTGCTCCCGTCCGCCCTTCTCCTCTTTCTC10.6666666666666667No Hit
GTCCGTCTCTGCGTCTCTTTCTGTCGGCTGCCCGGTCGTCTCGTCCCTCCT10.6666666666666667No Hit
GTGCCGTCCCTCCCCCCCCCCTCCCCTCTCTGACTTCCCCTCCCTCCTTCC10.6666666666666667No Hit
CCTCTCCCTGCCCCCCTCCCTTTGCCTTTTGCCCCCTCCCTTCCTCCTCTG10.6666666666666667No Hit
CCGTCCCTGCCCTCCCCCTCCTCTCTCTGTCTTCCTCCCTCTCCTTTTCCT10.6666666666666667No Hit
CCTTCTGTCCCCCCTCCTCCCTCTCCACCCGTCCTTCACGCCCGCCTCCGG10.6666666666666667No Hit
TTGGCTCCCCCCGTGTGGCCTCGTTTGGCCGCCTTCTCCTTNACGCCTTCC10.6666666666666667No Hit
CCTGCCCCCTCCCGCCCCCCTTTCCTGTTCTGTTTCGCTCTCCCTCTTGTC10.6666666666666667No Hit
CCCCTTCGCCCTCTCCCGCTGCCATATTCTTCTCACGCGTTCCGCCCTCGC10.6666666666666667No Hit
CTCCGCGCTGCGGCTCTCGCCCGCCCCGCTTGGCCCTCTCTCCGTCTCTTC10.6666666666666667No Hit
CTGCGTCCTTCTCTGCGTCTCTTTCTGTCGGCTGTCCGTCCGTCTCGTCCC10.6666666666666667No Hit
CCGCCTCCTGCCCCCTGGCCGCTCCTCCCCTCCCGCCCCTCCCGCCCCGTC10.6666666666666667No Hit
CCCCTGCTCGGGCCCCTCGTGCCCCTCTCCGCCCCGCCCTCCCGTCCCCCT10.6666666666666667No Hit
GTCCCTGCCCCCCCCCTCCCCGCTCTGTCTTCCCTCCCCTCCTCTTCCTCT10.6666666666666667No Hit
CTTTCCCCGTCTTCTCCCTCCTCCCAGCCGCTGCCATGCCCCCTTTTTCTT10.6666666666666667No Hit
CGCCCTCGCCCCCCTTGCCCTTTCCCCCCTCGGTCGCCTTGTTCCCCGCTT10.6666666666666667No Hit
CTGTTTCTCCGCGCTGGGCCGCCGCTGCGCGGTGCCGCTTCTCTTGGCCCT10.6666666666666667No Hit
TCCTCTTCGTCTTCCGCCTCGCCCGCCTCCTCTGTCCCGCCCCCGGCCTGC10.6666666666666667No Hit
CCCGCCGCCTCCTCCTCTCCCGCCCTCCCTCCTGGCTGTCGTCGTACCGCT10.6666666666666667No Hit
CGCCCCCCTGTCCTGGTCTGGTTCGCCCTCCCTCTTGTCCCTGCCCCCTCC10.6666666666666667No Hit
TCGTCGCCCTCCCCTTTTCCTGTTTCCGCCTGCCGTCTTCTGCTTGTCCGC10.6666666666666667No Hit
CCTCGGTCTCGCGCTTGCCTCGGTCCGTCTTCTCGCCTGTGTGCCTCCTGC10.6666666666666667No Hit
CCCTCGCCGCCCCTCCCCTAACCGCACCCCCTCCCTGCCTGGGTCCCGCTC10.6666666666666667No Hit
CCTCCCGCGCCCCTTTCCTGTTCTGTTTCGCCCTCCCTCTTGTCCCTGCCC10.6666666666666667No Hit
CCTTCTCCTTCCCGCCTTCCCTCTCCGGCTTCTCCTTACCCTTGTCTCGGT10.6666666666666667No Hit
TTTTGTTTCCCCTGCCTCTGCCGGTGTCCTGCTCTTCTCTTGCCCCTTTGC10.6666666666666667No Hit
TCGCTCGCTTCCTGTCTCCGCTCGCCCTTCCCGCCCTCGTGCCGCCCCTTC10.6666666666666667No Hit
CCCCCTCCCCCTCTCGCCCCCCCCCCTCGCCTCCGTCGTGCCTCGCGCTGT10.6666666666666667No Hit
CTTTTCCTCTGCCTGCCCCCCTCCCTTTGTCGATTGCACCCNCTCTTCCTC10.6666666666666667No Hit
CGCCCGCCCTCGGGCGTGTTTCTGCGTCCCTCCGCCCTTCTCTGTGTCTCT10.6666666666666667No Hit
TCCTCGCTCTGCCCCCCTCCCCCGTCCCCGCGTCCCGTCCTCTGTTTCTCC10.6666666666666667No Hit
TTCTGCTTCTCTGCGTCCTTCTCTGCGTCTCTCTCTGTCGGNTGCCCGGTC10.6666666666666667No Hit
GCCTTTGTGCCCCTCTCCTCCGCTCTTACTGTCCTCCTCTGGTCCCTCTCC10.6666666666666667No Hit
TCCCCCTCTCCTCTGGCCTCTTGGCCTCCCTTCTCTTCCTCGTTGCTGCTT10.6666666666666667No Hit
TGTCCCCTCCTCTGCCCCTCCGTCGTGTTCGCCCCCCCTTGCGTCGCCCCC10.6666666666666667No Hit
CGTCTCCACCCTCGCGCCCCCGCCGCCCCTTGCTGCTGTGTTGCCACGGCC10.6666666666666667No Hit
TCCCGTCCTTCGTTCCCTATCCTGGCGCACCCATCGTCTTTACCCCGGGTA10.6666666666666667No Hit
CTTTTCCTCTGCCTCCCCCCCTCCCTATGTCTCCTGCCCCCTCTCTTCCTC10.6666666666666667No Hit
CCCCCTCTCTTCCTCCCCTGTCCCCTTGCCCCTCCCTATGCNTGCCCCCTC10.6666666666666667No Hit
CCCCCCCTCCCCGCCCCCCCCTGCCTCCGCCCTCCTCTCTCTCTCCCCTCC10.6666666666666667No Hit
CGCCCCTCCCGCTCCCTGTTCCCGTCGCCCCGCTCTCTGCGNTCTGCCGGC10.6666666666666667No Hit
CCCTCCCCTCTTCTCCCTCTCTCCTCTTTCCGACCCTCTCCNTCTCTCTCT10.6666666666666667No Hit
CCCCCCTCCTCCCTCTCTTCCCGTCCTTCTCCACCGCATCCNCCGCCGTCC10.6666666666666667No Hit
TCCCTGCTGCCTGGTTCCTCTTCTCTTGCCTGCCCCTTGTCGCCTCTCGTT10.6666666666666667No Hit
CTCTCCTCCTCCCCTGGTTCCTTGCCACTCCCTCTGCCTGCCCCCGCCCGC10.6666666666666667No Hit
CCGCTCCCCCGCCGCCCTCTTCGGCGCCGTGGCTTCGTGCCCTTCCGTTTT10.6666666666666667No Hit
TCTGTCTCGCCCTCCCGCTTGTCCCTGCCCTCTCCCCCTGTTCCGCGTCTG10.6666666666666667No Hit
CCCCCCCTCCCCTCGTCGTCTTCTCTGTCTTGTCGGTTCTCCTCTGCCTGC10.6666666666666667No Hit
CCGCCTTCCTCGCTCCTGCCCTGGCTTTCTGGTCCCCTGCTGCCTCCTTCC10.6666666666666667No Hit
CCCTGGTCTCCGCCGCTCCCCGCCGCCCCACCTCTCCNCCCCTTCTTCTCC10.6666666666666667No Hit
CCGGCCTCTCGTTGGCGCCGCTCTCTTTCTCCCCGTTCTTCCCTCTGTCCT10.6666666666666667No Hit
TTGCCTCCCGCTCGCTGGCCGGCCCGGTGGTGGCCGCGTGTTGTCCTCCCG10.6666666666666667No Hit
CCTCTCCCCGTCCCCTTTCCTCGCCGGCTCTCCTCTCCCGTCCCCCTCCCC10.6666666666666667No Hit
TCCTTGCCTGCTCCCCCCTCTCCCCTCTCACCCGGCGCTGGCTGGGTCCCG10.6666666666666667No Hit
CCCCCTCTCTTTCTCCCCTGTCCCCTTGCCCGTCCCTGTGCNTGCCCCCTC10.6666666666666667No Hit
CCTTCTCGCGTGCCGCGGTTCCTCCCCTCCGTCTTTGCCCTTTTTCTCTCT10.6666666666666667No Hit
TTTCCTGTTCTGTTTCGCCCTCCCTCTTGTCCCTGTCCCCTCCCCTCTTTC10.6666666666666667No Hit
CCCTCCCTCTCCGTCTTTGCTTTGCTCCGTTGACCCGTGCCNACCCCCCTC10.6666666666666667No Hit
CTTTGCGCTCCTTTGCCCCCCTTCTGGCCGCGCTCTTGTCGNCGTCCCCCT10.6666666666666667No Hit
GCGCCGCCCGGCCTCGTGCGTGTTTCTGCTTATCTGCATCCNTCTCTGCGT10.6666666666666667No Hit
TTTTCCTGCTCTCGCTCGTTGGGCCCTCCTGCCCCCCCCGGCCGCCCCCTT10.6666666666666667No Hit
CCTGGCCTGCCGCCCGCCGCGGCTCTTCTGCATCCCACCCCNCCTCTCTTC10.6666666666666667No Hit
CCTCCCCTGTCCCCTTGCCCCTCCCTCTGCCTTCCCCCTCGCGTCCCCCTT10.6666666666666667No Hit
CTCTCTCTCCCTGCGTCGCCCGGCCTCGTGCATGTTTGTGCNTCCCTGCGT10.6666666666666667No Hit
TGCCTTGGCGTTGCCTCTCTGCGTCCCCCTTTTGCCACCCGCTACGTCGGC10.6666666666666667No Hit
TCTTGCTCTTTCCGCCTCTCTCTCTTCCGTCCCCGCCTTCGTTGTCTCCCT10.6666666666666667No Hit
TCGGCCTTGCCCCTCTGCCGCCCTCCGTCCTTGCGTTTCCCGCTCCCCTCC10.6666666666666667No Hit
CCCCCCTCTCCTTTTCCTCTGCCTGCCCCCCTCCCTTNGTCTTTTGCCCCC10.6666666666666667No Hit
TGCTTTCGCCCGCTCTTGCGCCGCCGGTTCTGCTACACTTTTTATCGCTTC10.6666666666666667No Hit
CCCGCCCTCTCTGCTCCTCGCTCCCTCTCCTATCACACCCCTTCTCCCCAC10.6666666666666667No Hit
CGGCCTCCCTTCTCTCCCTCCTCCCTCCTCTCCCCCCTCCTTTCGTCTTCC10.6666666666666667No Hit
CCTCGTCCGGTCATCGCCCCCCCGTTTGTCCCCTTCTTGCTGGCACCTGTG10.6666666666666667No Hit
CTTGTCCCCGTTCCCCTCTGTTCCTTCTCCGCCTTGCCTTCTCCTTCGCTC10.6666666666666667No Hit
TCCTGTGCTCCTCTCCGCTTGCCTGCGGGGTCACGTCAGCTNCCTTCTGCC10.6666666666666667No Hit
CGGCCTCTGGCCGCCTCGTCCCCTTTTCCTCAGCCCCTGTGNCACTCTGCC10.6666666666666667No Hit
GCCTGCGCCTCTGGCTTGGTCTTGGCCGCCCGCGCGTGCGCGCGCGCCCGT10.6666666666666667No Hit
TCTGTCCTCTCTTGCCTGCTCTGTGCTGTCCATCAGCGCCGACTGCCGCTT10.6666666666666667No Hit
TTCTCGCTGCTCCCTGCCGGTTCCTCCTCCTACGTCCGTCTNCCCCCGTCC10.6666666666666667No Hit
TGCCCCCCCCCTCCCCTCTCTGTCTCCCCTCCTCTCCGCCTCCTCTCCCCG10.6666666666666667No Hit
CCCTCTCTCCCCGTCCTTCTCGCCCCTCTCCGTTGGCGTCCCTGGCCCCCC10.6666666666666667No Hit
GCCTGCCGCGCCCTCCCTGCCCCTCCCCTCCTCTCTCTGTCTTCCCCCCCC10.6666666666666667No Hit
TGCCTTTTTTGCTCCTCTCTGCTTTTCGCGCCCTTCCCCTCTTCCCTTCCG10.6666666666666667No Hit
TCCTCCTCCCCTGTCCCCTTGCCCCTCCCTCTTCCTGCCCCCTCCCGCCCC10.6666666666666667No Hit
GTCTCCCTCCTGCCGCCGCCCGTCTGTCCCCCCTCCTCCCTCTCTTCCCGC10.6666666666666667No Hit
GCCCCCCTCCCTTTGTCTTGTGCCCCCTCTCTTCCTCCCCTGTCCCCTTGC10.6666666666666667No Hit
TCTTTTCCTCTGCGTCCTGGCCCTCCTCCGGTGCCCCCCCTCCTCCCTTTC10.6666666666666667No Hit
TGTCTTGCCCCCCGGCCTCGCTTCTTCTTGTCGCCCCCTACCCCCGCGCTG10.6666666666666667No Hit
CGGCTGCCTCTTCGCGCCCCTCCCACTCTCGTTTCCCCCTCTCCGCTCCCT10.6666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers