FastQCFastQC Report
Fri 15 Mar 2024
AA02_2924_a_merged.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameAA02_2924_a_merged.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences1934
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length87-58976
%GC30

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATGTCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG120.6204756980351602No Hit
ATGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCTTCT100.5170630816959669No Hit
ATGTAGTCTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG60.3102378490175801No Hit
TTATGTCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTC40.2068252326783868No Hit
TTTTCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG40.2068252326783868No Hit
GTTATGTCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATT40.2068252326783868No Hit
ATGTACATCTATTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG30.15511892450879006No Hit
TGTCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGC30.15511892450879006No Hit
TTATGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCTT30.15511892450879006No Hit
ATGCCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG30.15511892450879006No Hit
ATGTTTTTGCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGA30.15511892450879006No Hit
TTGTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCTT30.15511892450879006No Hit
ATGTACCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCT30.15511892450879006No Hit
ATGCCCTCTACTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGC30.15511892450879006No Hit
GTGTTATGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG30.15511892450879006No Hit
ATGTTTTGTAACCTACTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGAT20.1034126163391934No Hit
GTGCCCTCTACTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGC20.1034126163391934No Hit
ATGCCCTCTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG20.1034126163391934No Hit
TTTATGTGCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGAT20.1034126163391934No Hit
ATGTCCTCTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG20.1034126163391934No Hit
TTTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCTTC20.1034126163391934No Hit
TTTTGCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCT20.1034126163391934No Hit
ATGTGCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCT20.1034126163391934No Hit
ATGTTACTGTTTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATT20.1034126163391934No Hit
ATGTCCTCTACTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGC20.1034126163391934No Hit
ATGTCCTGTTCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG20.1034126163391934No Hit
GTGTAACCTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG20.1034126163391934No Hit
TTTGTCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCT20.1034126163391934No Hit
TATGTATCTTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCT20.1034126163391934No Hit
TTTTTTGCCTGTTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGAT20.1034126163391934No Hit
GTCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCT20.1034126163391934No Hit
TCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCTT20.1034126163391934No Hit
TTTTTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCTTC20.1034126163391934No Hit
ATGTTTTTACTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGAT20.1034126163391934No Hit
ATATGTCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTC20.1034126163391934No Hit
TTTACGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCT20.1034126163391934No Hit
TTTTATGTACCTTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGAT20.1034126163391934No Hit
ATGTTCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCT20.1034126163391934No Hit
ATCTTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCTTC20.1034126163391934No Hit
GTAACCTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCT20.1034126163391934No Hit
CTTTTCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCT20.1034126163391934No Hit
TTATGTCACTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATT20.1034126163391934No Hit
ATGCCTGTTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG20.1034126163391934No Hit
ATCATCTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCT20.1034126163391934No Hit
ATGTACTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCTTCTT20.1034126163391934No Hit
TTGCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGC20.1034126163391934No Hit
ATGCATCTTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG20.1034126163391934No Hit
GTGTTATGTACGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGAT20.1034126163391934No Hit
TGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGCTTCTT20.1034126163391934No Hit
ATGTGTAACCTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTC20.1034126163391934No Hit
GTGCATCTTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTG20.1034126163391934No Hit
ATGTTTCCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTC20.1034126163391934No Hit
TGTAGCTTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATTCTGC20.1034126163391934No Hit
GTTATGTCCTCTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATCCGATT20.1034126163391934No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

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