FastQCFastQC Report
Mon 29 Jan 2024
000000000-LDHC6_l01_n02_ITSChi461.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-LDHC6_l01_n02_ITSChi461.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC58

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[FAIL]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CGGCTGCGTTCTTCATCGATGCGCAAGCCAAGAGATCCGTTGTTGAAAGT312.5No Hit
CGGCTGCGTTCTTCATCGATGCGAGAGCCAAGAGATCCGTTGTTAAAAGT312.5No Hit
ACGCCGTGCAGGCCACCTGAGACCTTGTAGCTGTTCTGGTTGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACGCCGTGAAAGCCTCCCGACGCCTCGTAGACCTTCGAATCGAACTTTCC14.166666666666666No Hit
CGGCTGCGTTCTTCATCGATGCCAGAACCAAGAGATCCGTTGTTGAAAGT14.166666666666666No Hit
ACCCCATGTAAGCCGCCGGAGACCTTGTAGGAATTCTGGTCGAACTTACC14.166666666666666No Hit
ACCCCGTGGAGGCCTCCCGAGACCTTGTAGGAATTCTGGTCGAATTTCCC14.166666666666666No Hit
ACGCCGTGAAGACCACCTGAGACCTTGTAGCTATCGTTCGCAAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACACCGTGCAGACCGCCGGACACCTTGTAACCGCCGCCACCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACTCCGTGGAAGCCGCCCGAGGCCGCGTACGACCCGCCGCCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
AGCCTAGACATCCACTGCTGAAAGTTGGTGGAAGTGATCGCAAAAACGAC14.166666666666666No Hit
ACGCCGTGGAAACCACCGGATGCCGCGTAGGAGCCGCCGCCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
CGGCTGCGTTCTTCATCGATGCGCGAGCCAAGAGATCCGTTGTTGAAAGT14.166666666666666No Hit
ACGCCGTGGAGACCGCCAGACACCTTGTAGCTGTTCTGGTTGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACTCCGTGGAGACCGCCGGAGACCTTGTACCCGTCGCCGCCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACTCCGTGAAGTCCGCCTGAGACCTTGTAGCCGGAGCCACCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACCCCGTGGAGGCCGCCAGAGGTCTCGTAGACCTTGCTGTCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACCCCGTGTAGGCCGCCAGACACCTTGTAGGCGTTGTCGTCGCTGGTGTT14.166666666666666No Hit
ACGCCGTGCAGGCCGCCTTAGGTCTGGTAGGCCTTGCCGGAGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACGCCGTGCAGGCCTCCAGAGACCTTGTAGGAATTCTGGTCGAATTTTCC14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)