FastQCFastQC Report
Mon 29 Jan 2024
000000000-LDHC6_l01_n02_GyrBATH6.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-LDHC6_l01_n02_GyrBATH6.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC63

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACACCGTGTAAGCCGCCTGAGGTTTCATAGGCTTTGCCCGAGAACTTGCC28.333333333333332No Hit
ACCCCGTGTAGGCCTCCCGAAACCTTGTAGGAATTCTGGTCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
AGGCCGTGGAGTCCACCCGAGGTTTCGTAAGCCTTGGAATCGAATTTGCC14.166666666666666No Hit
ACCCCGTGCAGACCGCCCGAGGTCTTGTAGCCGTTGCCGCCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACGCCGTGAAGGCCGCCCGACACCGAGTACCCGCCGCCGCCGAACTTTCC14.166666666666666No Hit
ACTCCATGTAGGCCACCGGACACGGCGTAGGCGCCGCCGCCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACGCCGTGCAGTCCGCCGGAGACCTTGTAGGCGTTCTCGTCGTTGGTGTT14.166666666666666No Hit
ACACCGTGGAGACCACCTGAGACCTTGTAGCCGTCGCCGCCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACGCCATGCAAGCCGCCGGAGACCTTGTAGGCATTCTCGTCGTTGGTGTT14.166666666666666No Hit
ACTCCATGAAGGCCGCCTGAGGTTTCGTAGGCCTTGCCCGAGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACGCCATGGAGTCCGCTGACACCTTGTAGCCGGAGCCGCCGAACTTGCCG14.166666666666666No Hit
ACTCCATGTAAGCCACCAGAGACCTTGTATGAATTCTGGTTGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACTCCGTGTAGGCCGCCGGAGACGCCGTAGGACTTGCCGTCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACACCGTGGAGGCCGCCCGAGACCTTGTAGGCATTGTCGTCGGACGTATT14.166666666666666No Hit
ACGCCGTGTAATCAACCAGAGGTCTCGTAGACCTTGCTGTCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACTCCGTGGAATCCGCCTGACACCTTGTAGGAATTCTGGTCGAACTTTCC14.166666666666666No Hit
CGGCTGCGTTCTTCATCGATGCGCAAGCCAAGAGATCCGTTGTTGAAAGT14.166666666666666No Hit
ACGCCGTGTAATCCGCCAGACACCTTGTAGCTGTTCTGGTTGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACACCGTGCAAGCCTCCGGAGACCTTGTAGGAGTTCTGGTTGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACACCATGAAAGCCACCGGAGACCTTGTAGGAATTCTGGTCGAATTTTCC14.166666666666666No Hit
ACGCCATGAAAGCCGCCTGAGACCTTGTACGAGTAGTGGTCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACGCCGTGCAAACCGCCGGACACCTTGTACGAGCTCTTGTCGAACTTGCC14.166666666666666No Hit
ACTCCGTGCAGTCCACCGGAGACCTTGTAGGCATTGTCATCCGAGGCGTT14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)