FastQCFastQC Report
Mon 29 Jan 2024
000000000-LDHC6_l01_n01_ITSChi461.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-LDHC6_l01_n01_ITSChi461.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC58

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTG625.0No Hit
GGCTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTCTCCGTAGGTG28.333333333333332No Hit
CGGAAGGATCATTACCACACCTAAAACTATCCACGGGAACCACTTTGTAC14.166666666666666No Hit
CGTCCCGGCATGTATATTGGCGACACCGACGACGGCTCCGGCCTGCACCA14.166666666666666No Hit
CGTCCCGCTATGTACATCGGCGGTACCGACGCGCGCGGCTCTCACCACCT14.166666666666666No Hit
CGCCCGGCTATGTATATTGGCGGCACCGACGAGAAGGCCATGCACCACCT14.166666666666666No Hit
CGGCCGGCAATGTACATTGGCGGCACCGACGAGCGCGCGCTGCACCACCT14.166666666666666No Hit
CGTCCGGGCATGTACATCGGCGACACGTCGGACGGCACCGGCCTGCACCA14.166666666666666No Hit
AGGCCTGGGATGTATATTGGCGACACCGATGACGGTTCGGGCCTGCATCA14.166666666666666No Hit
CGACCGGGAATGTACATCGGGTCCACCGGTCCGCGTGGTCTGCACCACCT14.166666666666666No Hit
CGCCCCGGTATGTACATCGGCTCGACCGATTCCCGCGGGCTCATGCACTG14.166666666666666No Hit
AGCCCCGCTATGTATATCGGCGACACCTCCGACGGCACGGGCCTGCACCA14.166666666666666No Hit
AGGCCGGCAATGTACATCGGCGACACAGACGACGGCTCGGGTCTGCATCA14.166666666666666No Hit
AGGCCGGCGATGTATATTGGGTCCACCGACTCCCGCGGACTCATGCACTG14.166666666666666No Hit
CGACCGGGTATGTACATCGGCGGCACGGACGAAAAGGCGCTGCATCATCT14.166666666666666No Hit
CGACCGGGTATGTATATCGGCGACACCGACGACGGGTCGGGCCTCCACCA14.166666666666666No Hit
AGACCGGGTATGTACATCGGCTCGACCGGCATCCGTGGCCTACATCACCT14.166666666666666No Hit
AGGCCGGCAATGTACATTGGGTCCACCGGTGAGCGCGGCCTGCACCACCT14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)