FastQCFastQC Report
Mon 29 Jan 2024
000000000-LDHC6_l01_n01_GyrBATH6.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-LDHC6_l01_n01_GyrBATH6.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC62

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CGACCGGCAATGTACATCGGCGACACCGACGACGGCTCGGGCCTCCACCA14.166666666666666No Hit
AGACCTGCAATGTACATCGGCGACACCGACGACGGTTCCGGCCTGCATCA14.166666666666666No Hit
AGGCCAGGGATGTACATAGGCGACACCGATGACGGGTCCGGCCTGCACCA14.166666666666666No Hit
AGACCTGCGATGTATATTGGCGGCACCGGCGAGCGCGCCCTGCACCACCT14.166666666666666No Hit
CGGCCAGGGATGTATATTGGGTCGACGGGTCCGCGCGGCCTGCACCACCT14.166666666666666No Hit
AGTCCAGCAATGTACATAGGCGGCACAGACGAGCGGGCGCTGCATCACCT14.166666666666666No Hit
AGCCCGGGCATGTACATCGGCGGCACGGACGAAAAGGCGCTGCATCATCT14.166666666666666No Hit
CGACCGGCCATGTATATTGGCGACACCGACGATGGTTCGGGCCTTCACCA14.166666666666666No Hit
AGACCCGCTATGTACATTGGGTCCACCGACAGCAAGGGCCTCACGCACCT14.166666666666666No Hit
AGTCCAGGGATGTACATCGGCTCGACCGGCGAGCGCGGCCTGCACCACCT14.166666666666666No Hit
CGGCCCGCGATGTATATTGGATCGACGGGGCCGCGCGGTCTCCACCACCT14.166666666666666No Hit
GGCTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTTGGTG14.166666666666666No Hit
CGCCCTGCAATGTACATAGGTGGCACCGACGCCAACGCGCTGCACCATCT14.166666666666666No Hit
CGGCCGGCAATGTACATCGGCGACACCGACGACGGCTCGGGTCTTCACCA14.166666666666666No Hit
CGTCCGGGAATGTATATTGGCGACACCGACGACGGTTCCGGCCTGCACCA14.166666666666666No Hit
AGACCGGCAATGTACATTGGCGATACCGACGACGGATCGGGCCTCCACCA14.166666666666666No Hit
AGTCCGGCTATGTACATTGGCGACACCACGGCCCGCGGCCTGCACCACCT14.166666666666666No Hit
CGTCCTGGCATGTATATCGGCTCCACCGGCGAGCGGGGGCTGCACCACCT14.166666666666666No Hit
AGACCGGCGATGTATATTGGCGACACGTTAGACGGCACCGGCCTGCACCA14.166666666666666No Hit
AGGCCCGCGATGTATATTGGCGACATCGGCGAGCGCGCTCTGCACCACCT14.166666666666666No Hit
CGGCCGGGGATGTATATCGGCGATACCGACGACGGGTCGGGCCTGCACCA14.166666666666666No Hit
CGTCCAGGGATGTATATTGGATCCACGGGTCCGCGCGGTCTCCACCACCT14.166666666666666No Hit
CGACCCGGGATGTATATTGGCGACACCGACGACGGTTCGGGTCTGCACCA14.166666666666666No Hit
CGCCCAGGCATGTACATTGGCGGCACCGGCATCTCCGGCCTCCACCACCT14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)