FastQCFastQC Report
Tue 16 Jan 2024
000000000-LC922_l01_n01_GyrBATH874.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-LC922_l01_n01_GyrBATH874.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences96
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC62

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GATGAGTCAGCGTCGAACAGATGTGTATAAGAGACAGCCAGCAATATTCA33.125No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAATAGCCGTTCACTATGTTGCGGTTACTCACTGTC22.083333333333333No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACATCCTGTCCACTATGTTGCGGTTACTCACTGT22.083333333333333No Hit
CGCCCTGGAATGTATATCGGGAGCACCGGTCCGAGCGGCCTCCACCATCT11.0416666666666665No Hit
AGCCCAGCGATGTACATCGGGTCCACGGGCATGCGCGGCCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
AGACCGGGTATGTACATCGGGTCCACCGGCCTGCGTGGACTGCATCACCT11.0416666666666665No Hit
CGTCCAGGGATGTATATTGGCGGCACCGACGAACGCGCCCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
AGGCCTGGGATGTATATTGGCGATACGGATGACGGGTCGGGCCTGCATCA11.0416666666666665No Hit
AGTCCCGGAATGTACATCGGCTCCACCGGCGAGCGAGGTCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGTCCTGCAATGTATATCGGCGATACCGACGACGGTTCCGGCCTCCACCA11.0416666666666665No Hit
AGACCAGGTATGTACATTGGCTCGACAGACGAGCGCGGTCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
AGTCCGGCTATGTACATTGGCTCGACCGGCGAGCGCGGCCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
AGGCCCGGTATGTATATCGGCGACACCGACGACGGTTCCGGCCTCCACCA11.0416666666666665No Hit
AGTCCTGGCATGTATATCGGCTCCACGGGTGAGCCGGGCCTCCACCACCT11.0416666666666665No Hit
AGGCCAGCTATGTATATAGGCGACACCGACGACGGTTCAGGCCTCCACCA11.0416666666666665No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACCTTGGCGTCACTATGTTGCGGTTACTCACTGT11.0416666666666665No Hit
CGGCCTGGAATGTACATTGGCGATACCGACGACGGATCCGGCCTTCACCA11.0416666666666665No Hit
CGGCCGGGAATGTATATCGGCAGCACCGGTCCGGAGGGCTTGCACCATCT11.0416666666666665No Hit
CGGCCGGCTATGTATATCGGATCCACGGGGCCGCGCGGTCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGGCCCGGGATGTATATCGGGTCGACGGGCGAGCGCGGCCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
AGACCTGGTATGTATATTGGGTCCACCAGCGAGAACGGGCTCCACCACCT11.0416666666666665No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACATCACTATGTTGCGGTTACTCACTGTCTCTTA11.0416666666666665No Hit
AGGCCAGGTATGTATATTGGCTCGACCGGTCCGCGTGGACTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGGCCTGGTATGTATATAGGGTCCACCGGCGAGCGCGGCCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGACCGGGAATGTACATAGGCAACACCGGTCCGCGCGGGTTGCATCACCT11.0416666666666665No Hit
CGACCTGGCATGTATATCGGGTCCACCGGCGAGCGCGGCCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGACCCGGTATGTATATCGGCGACACCGACGACGGTTCGGGCCTCCACCA11.0416666666666665No Hit
CGTCCAGGAATGTATGTAGGCGACACCGATGACGGCTCCGGCCTGCATCA11.0416666666666665No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACATCTGATCACTATGTTGCGGTTACTCACCGTC11.0416666666666665No Hit
AGGCCTGGAATGTACATCGGCTCCACCGGCGAGCGCGGCCTGCACCACAT11.0416666666666665No Hit
AGCCCGGCGATGTACATCGGCTCCACCGGTGCGCGCGGCCTGCATCACCT11.0416666666666665No Hit
CGTCCCGGAATGTACATTGGCGACACCGATGACGGCTCCGGCCTGCACCA11.0416666666666665No Hit
AGACCTGGAATGTACATTGGCTCGACCGGGGAACGTGGACTTCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGGCCTGGTATGTATATAGGCTCCACCGATTCGCGCGGGCTCATGCACTG11.0416666666666665No Hit
AGCCCAGGGATGTACATAGGCTCGACCGACAGCCGGGGCGTCAACCACCT11.0416666666666665No Hit
AGCCCGGGAATGTATATTGGCAGCACCGGCCCTCGCGGGCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGACCGGGAATGTATATTGGTTCCACCGGCCCCTCGGGGCTCCACCACAT11.0416666666666665No Hit
AGACCGGGAATGTATATCGGCTCGACCGACGTGCGCGGTCTCCATCACCT11.0416666666666665No Hit
AGTCCTGGGATGTACATCGGCGGCACCGACGAACGCGCCCTTCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGTCCAGCAATGTACATCGGCTCCACCGGCGAGCGCGGGCTCCACCACCT11.0416666666666665No Hit
AGGCCCGGGATGTATATCGGCTCGACCGGGCTGCGGGGACTCCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGCCCGGGGATGTACATCGGCTCGACCGGCGAGATGGGCTTGCACCATCT11.0416666666666665No Hit
AGGCCGGGGATGTACATCGGCGACACGTCGGACGGCACCGGCCTGCACCA11.0416666666666665No Hit
AGACCAGGTATGTATATCGGCTCGACCGGCGCGCGTGGCCTCCATCACCT11.0416666666666665No Hit
CGACCTGGCATGTACATCGGGTCCACCGGGCCGGCGGGACTGCATCACCT11.0416666666666665No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACCCACGAGACTTCACTATGTTGCGGTTACTCAC11.0416666666666665No Hit
AGTCCCGGTATGTACATAGGCTCGACGGGCACCCGCGGCCTCCATCACCT11.0416666666666665No Hit
AGCCCGGGTATGTACATCGGCGACACCGATGACGGGTCCGGCCTGCACCA11.0416666666666665No Hit
CGCCCTGGTATGTACATCGGCAACACCGACGACGGCTCGGGCCTGCACCA11.0416666666666665No Hit
AGGCCAGGGATGTACATCGGGTCGACGGGCGTCCGCGGTCTCCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGTCCGGGAATGTACATCGGCGACACCGACGACGGGTCCGGCCTCCACCA11.0416666666666665No Hit
CGACCGGGCATGTATATCGGCTCCACCGGCGAGCGCGGACTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
AGACCAGCAATGTACATCGGCTCCACCGGCTCGCGAGGGCTCCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGGCCTGCGATGTACATCGGGTCGAACGGATCGCCCGGGCTCATGCACTG11.0416666666666665No Hit
CGCCCCGGCATGTACATCGGTGACACCGATGACGGCACGGGCCTCCACCA11.0416666666666665No Hit
AGTCCAGGGATGTATATCGGGTCCACCGGGGAGCGAGGACTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
AGACCGGGGATGTATATCGGCGACACCGATGACGGCTCCGGCCTCCACCA11.0416666666666665No Hit
CGTCCAGGAATGTACATCGGTTCGACGGGCGAGCGCGGCCTGCATCACCT11.0416666666666665No Hit
AGTCCTGCTATGTACATCGGCGACACCGACGACGGCTCCGGCCTGCACCA11.0416666666666665No Hit
CGTCCTGGGATGTACATCGGCTCCACCGGCGAGCGGGGGCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGGCCAGGTATGTAAATAGGCTCGACCGGAACGCGCGGCCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGACCGGCGATGTATATCGGCTCGACGGGCGACATGGGGCTCCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGCCCAGCGATGTACATCGGCGACACCGACGACGGCTCGGGCCTCCACCA11.0416666666666665No Hit
CGACCGGCTATGTATATCGGGTCCACGGGTCCGCGGGGGCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
AGCCCCGCGATGTACATCGGCTCGACCGATGAAAAGGGCCTGCATCACCT11.0416666666666665No Hit
AGTCCGGCAATGTATATCGGCTCGACCGATTCGCGCGGACTCATGCACTG11.0416666666666665No Hit
AGGCCGGCAATGTATATCGGCGATACCGACGATGGATCGGGCCTGCACCA11.0416666666666665No Hit
AGGCCAGGTATGTATATCGGCGACACCGACGATGCCTCCGGCCTCCACCA11.0416666666666665No Hit
AGTCCCGCGATGTATATCGGGTCGACCGACTCTCGTGGCCTCATGCACTG11.0416666666666665No Hit
CGGCCTGGCATGTATATTGGCGACACCGATGACGGCTCGGGCCTGCACCA11.0416666666666665No Hit
CGCCCAGCTATGTATATTGGATCCACCGACTCGCGCGGGCTCATGCACTG11.0416666666666665No Hit
AGGCCTGCAATGTATATCGGGTCGACGGGCTCGCGCGGCCTCCACCATCT11.0416666666666665No Hit
AGACCTGGCATGTACATAGGCGACACCGACGATGGCTCGGGCCTGCACCA11.0416666666666665No Hit
CGGCCGGCCATGTATATAGGGTCGACCGGTGAGCGGGGGCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGTCCAGCAATGTATATCGGCTCGACCGACTCGCGCGGACTCATGCACTG11.0416666666666665No Hit
AGACCAGGTATGTATATCGGGTCCACTGGTGAGCGCGGCCTGCACCATCT11.0416666666666665No Hit
AGGCCGGCAATGTACATCGGCGACACCGACGACGGATCGGGCCTGCACCA11.0416666666666665No Hit
AGGCCGGCTATGTATATTGGGGACACGGACGACGGCTCGGGCCTGCACCA11.0416666666666665No Hit
CGTCCAGCCATGTATATTGGGTCGAACGGATCGCCCGGGCTCATGCACTG11.0416666666666665No Hit
CGGCCCGGGATGTATATCGGCGATACCGACGATGGATCGGGCCTGCACCA11.0416666666666665No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAATAGCCGTTCACTATGTTGCGGTTACTCTCTGTC11.0416666666666665No Hit
AGACCAGGCATGTATATCGGCGGCACCGACGAGCGGGCGCTGCATCACCT11.0416666666666665No Hit
CGGCCGGCAATGTATATCGGGGACACCGATGACGGGTCGGGTCTTCACCA11.0416666666666665No Hit
AGACCCGGTATGTACATTGGCGACACCAGCGACGGCACCGGCCTGCACCA11.0416666666666665No Hit
AGACCAGCGATGTACATCGGCGGCACCGACGAAAAGGCGATGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGCCCCGGAATGTACATTGGCGACACGGGCCTGAAGGGCCTGCACCACTT11.0416666666666665No Hit
AGCCCTGCAATGTACATAGGGTGGTCTACACGGCGTCTGTCTCTTATACA11.0416666666666665No Hit
AGGCCGGCCATGTATATCGGCGGCACCGACGAGCGCGCCCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
AGGCCAGGGATGTATATCGGCGGCACCGACGAGAAGGCGCTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGTCCAGGAATGTATATCGGCTCGACCGGTGAGCGCGGATTGCACCACCT11.0416666666666665No Hit
CGCCCTGGTATGTATATTGGGTCGAACGGATCGCCCGGGCTCATGCACTG11.0416666666666665No Hit
CGACCGGGGATGTATATTGGGGACACCGATGACGGGTCGGGTCTTCACCA11.0416666666666665No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)