FastQCFastQC Report
Tue 7 Nov 2023
000000000-L65MN_l01_n01_PIELP3E05.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-L65MN_l01_n01_PIELP3E05.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC42

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[WARN]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTGTAAAGATAAATGGGTCATCTAAAGAGTATGGAGCTGGGATTGACTCG1033.33333333333333No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACATGCAACATTTATTGCATGATACGTGGCATTT516.666666666666664No Hit
TGTAAAGATAAATGGGTCATCTAAAGAGTATGGAGCTGGGATTGACTCGG13.3333333333333335No Hit
GACGCGTCCGCGTCTAACATGTACTCTTTATGACGTGATACGGGTCATTT13.3333333333333335No Hit
CTGTAAAGATAAATGGGTCATCTAAAGCGTATGGCGCTGGGATTGACTCG13.3333333333333335No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCCGTGGGCTCGAAGATTTCGTTGGG13.3333333333333335No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTTCTTGCGATCGAATCTTTCGTTT13.3333333333333335No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCGTCTGTGGCTCGAAGATTTCGTTG13.3333333333333335No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTGGGCTCGAAGATTTCGTTGGGGA13.3333333333333335No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACATGCAACATTTATTGCATGTTACGTGGCATTT13.3333333333333335No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTTTGGCGCGAAGATTTCGTTGGGT13.3333333333333335No Hit
CTGTAAAGATAAATGGGTCATCTAAAGAGTATGGAGCTGGGATTGCCTCG13.3333333333333335No Hit
TACCCTTACGTTGTTCCTGATTACGCTGGGCGCTCAGATTTCGTTGGGGA13.3333333333333335No Hit
CTGTAAAGATAAATGGGTCATCTAACGAGTATGGATCTGGGATTGACTCG13.3333333333333335No Hit
CTGTAAAGATAAATGGGCCATCTAAAGAGTATGGAGCTGGGATTGACTCG13.3333333333333335No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCATAAGAGTTTGCCAGCCCGCCTAA13.3333333333333335No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTCGAAGATTTCGTTGGGGACTCTG13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)