FastQCFastQC Report
Tue 7 Nov 2023
000000000-L65MN_l01_n01_JS9.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-L65MN_l01_n01_JS9.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences150
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC42

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GATGAGTCAGCGTCGAACATGCAACATTTATTGCATGATACGTGGCATTT5838.666666666666664No Hit
CTGTAAAGATAAATGGGTCATCTAAAGAGTATGGAGCTGGGATTGACTCG2617.333333333333336No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTCGAAGATTTCGTTGGGGACTCTG53.3333333333333335No Hit
ACGCCCAAGCAGATCTACTGGTTGAGCCGCAAGTGACTGTCTCTTATACA21.3333333333333335No Hit
ACGCCCAAGCAGATCTACAACCGCATGCAGAACGTCTATGCCGACCAGCA21.3333333333333335No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCCGTGGGCTCGAAGATTTCGTTGGG10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCGCAATGATTTAGGTTGGCACTCTT10.6666666666666667No Hit
CTGTAAAGGTAAATGGGTCATCTAAAGAGTATGGAGCTGGGATTGACTCG10.6666666666666667No Hit
GAGGCGTCAGCGTCTAACATGCACCCTTTATGTCATGATACGTGTCATTT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCCTCGCAGACTTCTTTGGGTCCTAT10.6666666666666667No Hit
ACACCCAAGCAGATTTACAACGATCCTGCCCACCTGTTCTTCGCCCGCTT10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACATGCACCATCTATTGCATGATACGTGGCATTT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGCTGTTCCTGCTTACGCCGTGGGCTCTAATATTTCTTTGGT10.6666666666666667No Hit
GATGCGTCCGCGTCGAACATGCACCATTTATTGCCTGATACGTGGCATTT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTCTAAGATTTCGTTGGGGACTCTG10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACATGCAACATCTATTACATGATACGTGGCATTT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGGTCTGTGTTCTCGAATCTGTCGTTT10.6666666666666667No Hit
GATGCGTCCGCGTCTAACATGAACCCTTTATGTCATGATACGTGTCATTT10.6666666666666667No Hit
CTGTAAAGATAAATGGGTCATCTAAAGAGTATGGAGCTGGGCTTGACTCG10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCGTGGGCCCGAAGTTTTCGTTGGGG10.6666666666666667No Hit
CTGTAAAGATAAATGGGTCATCTAAAGAGTATGGAGCTGGTACTGACTCG10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTGGGCTCGCAGATTTCGTTGGGGG10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTTCGTGTCTCGAATATTTCGTGGT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTGCGCACTTAGATTTCGGGGCGGA10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTTAACCTGACGCAAACGGACAATT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCCGTGGGCGCTAATAGTTCTTTGGG10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTTGGGCTCGAAGATTTCGTTGGGT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTGCGGTCGGAGATTTCGTTTGGGA10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGTTGGCTCTACTATTTCGCGTGGGAC10.6666666666666667No Hit
GATGCGTCAGCGTCTAACATGAACCCTTTATTGCATGATACGTGTCATTT10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCAGCGTCGACTAGCCGTTCACTATGCCAAGCGTCAGCAGGGCC10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACATGCAACATTTATTGCTTGATACGTGGCATTT10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACATGCAACATTTATTGCATGATACATGGCATTT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTGGGCCCTCAGATTTCGTTGGGGA10.6666666666666667No Hit
ACGCCCAAGCAGATCTACTGGTTGAGCCGCAAGTGACGTCTCTTATACAC10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCGTCTCTGTGCTCTAAGATTTTGTT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTCAACGAGCTCGTTGGGGGCCCTT10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCATCGTCGAAGCAGGCTGGAATCGATCGAGAACTGTCTGGACA10.6666666666666667No Hit
CTGTAAAGATTAACGGGACGTCTAAAGAGTATGGAGCAGGGATTGACTCG10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCCGGGGGCTCTAATATTGCTTTGGT10.6666666666666667No Hit
ACGCCCAAGCAGATCGACTGGTTGAGCTGCAAGTGACTGTCTCTTATACA10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGCTTACGCTGGGCCCTAAGATTTCGCTGGGGA10.6666666666666667No Hit
ACGCCCAAGCAGATCTACAACGACCCTGCCAACCTGTTCGTCGCCCGCTT10.6666666666666667No Hit
GATGCGTCCGCGTCTAACATGCACCCTTTATTTCATGATACGTGTCATTT10.6666666666666667No Hit
ACGCCCAAGCAGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGTCCGCAAG10.6666666666666667Illumina Single End PCR Primer 1 (96% over 33bp)
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCGTAGGCGCGTAGATGTCGGCCGGT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTCTCGGGGGTCGAAGCTTTCGTTG10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACACTGGCCTGAAGCAGCAGGCTATGTGTGGATG10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGGGAGGATCGAAGATTTCGTTGGGGA10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCAGCGTCTAACATGCAACATTTATTGCATGATACGTGGCATTT10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCAGCGTCGCACATGCACCATTTATTACATGATACGTGGCATTT10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCATCGTCGAACATGCAACATTTATTGCATGATACGTGGCATTT10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCGGCGTCGAACATGCAACATTTATTGCATCATACGTGGCATTT10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACATGCAACATTTATTGCATAATACGTGGCATTT10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCCGCGTCTAACATGCACCCTTTATTGCATGATACGTGGCATTT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTGGGATCTAAGACTTCGTTGGGGA10.6666666666666667No Hit
CTGTAAAGATAAATGGGTCCTCTAAAGAGTATGGAGCTGGGATTGACTCG10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTCGCGTGGCTCGAAGGTTTCGCTG10.6666666666666667No Hit
GATGAGTCAGCGTCGAACATGCACCATTTATTGCATGATACGTGGCATTT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTCGACGTGTTGGTTTGGGACTCTT10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTCTTCGTGTTCGTTTAGGAATCCG10.6666666666666667No Hit
TACCCTTACGATGTTCCTGATTACGCTTCTCCGTCGGCGCTATGGTTTTG10.6666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph