FastQCFastQC Report
Tue 16 Aug 2022
000000000-KG26R_l01_n02_HRB0336.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-KG26R_l01_n02_HRB0336.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC43

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTTGCAGAATGTAAGATGCTGAACGCTCATAAAAGGATGATCTGGCTTTT11.3333333333333335No Hit
TTGTGTGCCTCGGCTGATTCCTGGACGAGGGAGATCGGAAGAGCGTCGTG11.3333333333333335No Hit
GTTTTAATTATTCCAAACTTGAAAAATAGATTAATTTGATAAGATCGGAA11.3333333333333335No Hit
CGTGAGATCGATCGATGTTGTGGGTGGTACGAGCCGGCCGTGTGATGGCG11.3333333333333335No Hit
TCGCCTGTGAGCTCGGTCTGGCTAGCTGCTGCTGCGTACTAGCTTGGCTG11.3333333333333335No Hit
GTGTATAACTCAACAAACTGACTGATCGAAGTCGGTAAAAGAGTAGACGA11.3333333333333335No Hit
GAGATTAAAAAGACTACTATGTCATTCGTTAATACAGAAAGATAACAAAG11.3333333333333335No Hit
CACACCCGCGCCGCCCGCGCCACCCGCACTGTCGCACGCCTGCGCCGTGC11.3333333333333335No Hit
TGACTTCATATTGTCATACTTATCCCACTCTCCATATTTCATCCAGAGAT11.3333333333333335No Hit
TCGACGAGCTGCTGCTCGCTGAGGTCGAGGAGGTTACCGGTCTACACCAG11.3333333333333335No Hit
TTTTGTGGCTGCTCTGGAAGCTAAACCTACTCTGTTTGATCAAATTAGAG11.3333333333333335No Hit
TGATCTTACGCATGACATGTGTAAAAATTTCTTTCTAGCAATATTTTTCT11.3333333333333335No Hit
TTTGACTCCGCTTGTACTGTTGGTTTGACTGCAAAGATCGGAAGAGCGTC11.3333333333333335No Hit
CTTATGTTCTTCATGTAGCATTCAGATCGAATGACTCTATGAAATTACGT11.3333333333333335No Hit
TTCATTGGTTTTTCCTCTTTTTCTATCACTCACATTTTTGTAAGCTCTTG11.3333333333333335No Hit
CGGCAGCGCGCCTAGGAATCTGGGCGGCGAGCAAGAGATCTCAAGATCGG11.3333333333333335No Hit
CAAAGAATTCCGAATGGAATGATTTTGAATACCGATTAGATCGGAAGAGC11.3333333333333335No Hit
TGATGTTCCAATAAGCGTAACTTTCTCAATATGATAGAGATCGGAAGAGC11.3333333333333335No Hit
GAAACTATTGTTGATTCAAGTGCTAGAACATGCAGGAATGAGATCGGAAG11.3333333333333335No Hit
GTAATCCATTTACCACCAAAAGAGAATAGGACATGTGTCGGTAATTGAGT11.3333333333333335No Hit
ATTCATGCTGCAAATATATTTATCCCGAAATAGGTGATATAATATAATAC11.3333333333333335No Hit
CAACAGTACAATAGAAAAATAACCCTGTTCTCATGCCACCTATAAGATCG11.3333333333333335No Hit
CAACTTGACTCTTCTTCTTGTTTTGCCTTCAAAGCAACTTCTTGATTAGA11.3333333333333335No Hit
CTATATAGAATCATAATGAACAGAAAATAGCATCGATAGTACACACCCAA11.3333333333333335No Hit
CTGGAATGAAGCGAGACGTCGCAGAATACGTAGCCTTGTGAGATCGGAAG11.3333333333333335No Hit
AAATCAAGGTTCTTGATCTGCAGATTTCATCACTTTAAGAGATCGGAAGA11.3333333333333335No Hit
TAGTTGAGAGATTTTAGGATGTCGACCTTCGGCCGACAGATCGGAAGAGC11.3333333333333335No Hit
ATAACGAGTTAATGGTAATGTTCTTCTATTAAAATCTATTAGCAACTCAC11.3333333333333335No Hit
CTTAGCTCCTGGTTTGGAGTCATCTGTTCAGCCGGGTATGGTTGTTCAGA11.3333333333333335No Hit
ACGACGACGACGACGACTGCCGTCATCAGTAAGAAATCACATGAACAGAT11.3333333333333335No Hit
CCACAGAGGAGGATGGAGAGGAGGGAGTAGACGTAGAACATGGGGAGCAA11.3333333333333335No Hit
CGACCATGGGGGCTGCGTTGACGGTGTATGACATGCTAGATCGGAAGAGC11.3333333333333335No Hit
TTGTAAGTGTAACTAATGCATAACATGTTTCCTTGCAAAAGCTGAGTTCT11.3333333333333335No Hit
TTACGAGTTCTATCGGGTAAAGCCAATTATTAGAGGCATCGGGGGCGCAA11.3333333333333335No Hit
ACCCGCAAGTCGATGTTCGACTCCATGCTCGCCGGCTGAGATCGGAAGAG11.3333333333333335No Hit
CCTTGTGTGACATATCACCACTGGTACTTAATAAGATCGGAAGAGCGTCG11.3333333333333335No Hit
CGGCACCCGCGGCGCCGATCACCGCGCGGCCGAGGAGGCACGATGAACTC11.3333333333333335No Hit
TATATTTGGTCAAATTGAAATAAATTTTGCTAAATCCAAAAAAGAAAAAT11.3333333333333335No Hit
CCGTGCCAACCACAAGCCAGCATGGGCAACGGCTTTATCTTTTGTATAGC11.3333333333333335No Hit
AGTCTGAAGTTAGATGAGGTCAAGGAGGCTGCCAGCCGAATTGTGGGCTA11.3333333333333335No Hit
CTTTCTTTCCATTTTTCATGGCATGAATATGGAAGGGGCATGGCTATATG11.3333333333333335No Hit
TTTCTAAAAGGAGAAACATCAACATGACTCATACGCCACCAGATCGGAAG11.3333333333333335No Hit
ACCAAAAATGAAAAGAAAGGAAAATCGCCGGCCCGCACGCAACCGACCGC11.3333333333333335No Hit
TAATCTCTGCAAGTAATTTTTTTTTTTGGGCATAGAAGAAAAGAAGATCG11.3333333333333335No Hit
CCTTGTTAACTTTGCCTTCCGGTCATGGAATCGAGCTAGGTTTTTTTTTG11.3333333333333335No Hit
TTTCAACATCCCAATGCACAATGACTCCATCCTTTGATGCTGAAAATCCC11.3333333333333335No Hit
GACGAGCGCGGCGTCAAGGTGCTCACCGCGCTGGAGGAAGTGGGTACATC11.3333333333333335No Hit
TGCTCTGTGATGACGTCCCTAATCATGCATTTTGCTAGATCGGAAGAGCG11.3333333333333335No Hit
TAGAGACAAAGATAGAGATAAAGATCTCAACGTATGAGTTCATTTTGGAA11.3333333333333335No Hit
CACTGATCTTACGTAAGTCATCTGATTCCATTCATTATCCTTGACAAATA11.3333333333333335No Hit
ACGGCGGAGCCCAATTACAGGTTGTCGCCACCAAACTAAACACAAAAGCA11.3333333333333335No Hit
CTCTGAGATCTAATTTAGACTCTTATAATAATTATTTCTGCCCCTACGTA11.3333333333333335No Hit
CCAAAACCTAACAATTAACAGCAACAATTACAGATCGGAAGAGCGTCGTG11.3333333333333335No Hit
ATCAGTGTTCACCAAATCTTTCCACAAACAGAAAATCGTGTAGATCGGAA11.3333333333333335No Hit
CTTTCCAAATTAAGCCGCAGGAATTACCTTTTTCTTGTAAGTAAAGAAGA11.3333333333333335No Hit
ATTGCCTCATGAAGAGGTTCATCATGAAGATGAAAACCCATAATTAAAAT11.3333333333333335No Hit
CCTTGGAACTCTTCAAACTCTTCTCCGGCGAAAACAGACAGATCGGAAGA11.3333333333333335No Hit
CCGCTAGGTTCTCTAGGCAGTGTGCAGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGT11.3333333333333335Illumina Single End PCR Primer 1 (95% over 24bp)
TCGGGGCAGGAGTAACCCGACCCCCCTCGGGGAAATCAGGAGGAGGGAGA11.3333333333333335No Hit
TGAAGAAGGAAGTGATTGTTCTTCAGAGTTAAGCGGGTGGTGTTTTATTC11.3333333333333335No Hit
GTCATGGAATCGAGCTAGGTTTTTTTTGACGGCTGCAGAATAGATCGGAA11.3333333333333335No Hit
GTTCCAGAAATCAACTGAATCACAAGCAATATTGAATAAGATCGGAAGAG11.3333333333333335No Hit
ATAACAATCACAAGTCGGTGATGAAGCTGTATTTCCAGTCTGGTTCTTAT11.3333333333333335No Hit
CTTGCCGCCCACCACTGGAGCGGCAAGATCTATTTTTGTAATTTTTTTGG11.3333333333333335No Hit
CATACTGGAATTTATTGGATTTTATTTTCCGTTTTAGATCGGAAGAGCGT11.3333333333333335No Hit
TTGCTTCAATTGCGGCTCAATAAGATGGAATTTCGCAATGAGGCTGAATA11.3333333333333335No Hit
TGCGACGCGAGGAATTGAATCGATCAAAAAACACAAGATCGGAAGAGCGT11.3333333333333335No Hit
CAGCACGACGCGATCAGCGCCGCCGGCCTGCGGAGCTGCGGGATTCCGGC11.3333333333333335No Hit
AAGACCCAGCAGGCTTGCAGGGTGTGTTTCCTGGTTTTGTGGATAGGACA11.3333333333333335No Hit
GTGTTTCGTCAGTTTCTCCTCAATTTTTTTGTTCGAAATAAAGGGGAAAA11.3333333333333335No Hit
TGTTCGGTGCTTTTGCATCCCTCTCCCTCGTTTTTCCGTGAGATCGGAAG11.3333333333333335No Hit
TAAAATCAATTTTCCATACAGCATATGACACACTAGATCACCATTGTCCA11.3333333333333335No Hit
TAGAGGGAGGCGTGAGGTCGCAAGGCACGATCGTTAAGCTGAAGGAACCA11.3333333333333335No Hit
CCGGCGCCACCACCACCACCATGGCCTTCCTCCCCGCCGAGCGACAGGAG11.3333333333333335No Hit
CGACAGCGCCGCCGACGAGTAGAGCAGCACCTGCGAGATCGGAAGAGCGT11.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)