FastQCFastQC Report
Tue 16 Aug 2022
000000000-KG26R_l01_n01_HRB0336.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-KG26R_l01_n01_HRB0336.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC41

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCTTCTCTAATTTGATCAAACAGAGTAGGTTTAGCTTCCAGAGCAGCCAC11.3333333333333335No Hit
GAAAATTCTCAAGAGCTTACAAAAATGAGAGTGATAGAAAAAGAGGAAAA11.3333333333333335No Hit
TATAGGTGGCATGAGAACAGGGTTATTTTTCTATTGTACTGTTGAGATCG11.3333333333333335No Hit
CCTGTCGCTCGGCGGGGAGGAAGGCCATGGTGGTGGTGGTGGCGCCGGAG11.3333333333333335No Hit
CAGCCGGCGAGCATGGAGTCGAACATCGACTTGCGGGTAGATCGGAAGAG11.3333333333333335No Hit
CCGGCCCATCTAGCCCACAATTCGGCTGGCAGCCTCCTTGACCTCATCTA11.3333333333333335No Hit
GCGTGCGGCGGCACGGCGCAGGCGTGCGACAGTGCGGGTGGCGCGGGCGG11.3333333333333335No Hit
ATTTTTTTTGGAATTTTTCTTTTTTGGATTTAGCAAAATTTATTTCAATT11.3333333333333335No Hit
CTGGATGAAATATGGAGAGTGGGATAAGTATGACAATATGAAGTCAAGAT11.3333333333333335No Hit
TAGAAATCGACACTTTGTTATCTTTCTGTATTAACGAATGACATAGTAGT11.3333333333333335No Hit
GCCAAAAAAATTACAAAAATAGATCTTGCCGCTCCAGTGGTGGGCGGCAA11.3333333333333335No Hit
CTGCACGGTAGAGCGTGGAATTGGTCTGCTGGGTTGCTATACAAAAGATA11.3333333333333335No Hit
TGTGTTTTTTGATCGATTCAATTCCTCGCGTCGCAAGATCGGAAGAGCAC11.3333333333333335No Hit
GTCCCAATCATCTTGGGTGTGTACTATCGATGCTATTTTCTGTTCATTAT11.3333333333333335No Hit
TTCTGAACAACCATACCCGGCTGAACAGATAACTCCAAACCAGGAGCTAA11.3333333333333335No Hit
ATTCTGCAGCCGTCAAAAAAAACCTAGCTCGATTCCATGACAGATCGGAA11.3333333333333335No Hit
TTTTTTTTTTTTAGAAACGCTTTTTTCCCCTTTATTTCGAACAAAAAAAT11.3333333333333335No Hit
TCTTTTCTTCTATGCCCAAAAAAAAAAATTACTTGCAGAGATTAAGATCG11.3333333333333335No Hit
CTCCGGGCAGCTCCAGCAGGGGTGAGTTCATCGTGCCTCCTCGGCCGCGC11.3333333333333335No Hit
CTATCATATTGAGAAAGTTACGCTTATTGGAACATCAAGATCGGAAGAGC11.3333333333333335No Hit
CGAGAATGTCAAAAGCCAGATCATCCTTTTATGAGCGTTCAGCATCTTAC11.3333333333333335No Hit
CATGGTGCGCATGGCTGGTGTAGACCGGTAACCTCCTCGACCTCAGCGAG11.3333333333333335No Hit
CACGGAAAAACGAGGGAGAGGGATGCAAAAGCACCGAACAAGATCGGAAG11.3333333333333335No Hit
CTTCCGAGGTCATAAGGTCCTGGTGTCCTATCCACAAAACCAGGAAACAC11.3333333333333335No Hit
ACTCAATTACCGACACATGTCCTATTCTCTTTTGGTGGTAAATGGATTAC11.3333333333333335No Hit
CTACTTCAGCCAAGCTAGTACGCAGCAGCAGCTAGCCAGACCGAGCTCAC11.3333333333333335No Hit
AATCGATATTCAAAATCATTCCATTCGGAATTCTTTGAGATCGGAAGAGC11.3333333333333335No Hit
AAAATGCATATAGCCATGCCCCTTCCATATTCATGCCATGAAAAATGGAA11.3333333333333335No Hit
AGCAAAATGCATGATTAGGGACGTCATCACAGAGCAAGATCGGAAGAGCA11.3333333333333335No Hit
GTCGGCCGAAGGTCGACATCCTAGAATCTCTCAACTAAGATCGGAAGAGC11.3333333333333335No Hit
TAGAAGAACTCAACTTTTGCAAGGAAACATGTTATGCATTAGTTACACTT11.3333333333333335No Hit
CTTAAAGTGATGAAATCTGCAGATCAAGAACCTTGATTTAGATCGGAAGA11.3333333333333335No Hit
GATTTGTGCAAGAAGAAAAATATTGCTAGAAAGAAATTTTTACACATGTC11.3333333333333335No Hit
TGTTTTCTCTTTATTGCCCGTGAGTTGCTAATAGATTTTAATAGAAGAAC11.3333333333333335No Hit
GTTCATGTGATTTCTTACTGATGACGGCAGTCGTCGTCGTCGTCGTAGAT11.3333333333333335No Hit
GCGTTGCGCCCCCGATGCCTCTAATCATTGGCTTTACCCGATAGAACTCG11.3333333333333335No Hit
GGTTCCTTCAGCTTAACGATCGTGCCTTGCGACCTCACGCCTCCCTCTAA11.3333333333333335No Hit
TATTCAATATTGCTTGTGATTCAGTTGATTTCTGGAACAGATCGGAAGAG11.3333333333333335No Hit
TACTCTGTTTCTTCTTTACTTACAAGAAAAAGGTAATTCCTGCGGCTTAA11.3333333333333335No Hit
TGAGATCTCTTGCTCGCCGCCCAGATTCCTAGGCGCGCTGCCGAGATCGG11.3333333333333335No Hit
GTATTATATTATATCACCTATTTCGGGATAAATATATTTGCAGCATGAAT11.3333333333333335No Hit
GCGGTCGGTTGCGTGCGGGCCGGCGATTTTCCTTTCTTTTCATTTTTGGT11.3333333333333335No Hit
TTACGTAGGGGCAGAAATAATTATTATAAGAGTCTAAATTAGATCTCAGA11.3333333333333335No Hit
CCCTCCTCCTGATTTCCCCGAGGGGGGTCGGGTTACTCCTGCCCCGAAGA11.3333333333333335No Hit
ACACGATTTTCTGTTTGTGGAAAGATTTGGTGAACACTGATAGATCGGAA11.3333333333333335No Hit
TCCAAAATGAACTCATACGTTGAGATCTTTATCTCTATCTTTGTCTCTAA11.3333333333333335No Hit
CACAAGGCTACGTATTCTGCGACGTCTCGCTTCATTCCAGAGATCGGAAG11.3333333333333335No Hit
GGAAAAGAAAATGCAGATTGGACAATGGTGATCTAGTGTGTCATATGCTG11.3333333333333335No Hit
CTGCTGTTGTTTTATCCAAGGACAGTGATAAGGGATTTTCAGCATCAAAG11.3333333333333335No Hit
TGCTCCCCATGTTCTACGTCTACTCTCTCCACTCCATCCTCCTCTGCGGA11.3333333333333335No Hit
CCTGATATTTGTCAAGGATAATGAATGGAATCAGATGACTTACGTAAGAT11.3333333333333335No Hit
TGCATTTTAATTATGGGTTTTCATCTTCATGATGAACCTCTTCATGAGGC11.3333333333333335No Hit
TATCAAATTAATCTATTTTTCAAGTTTGGAATAATTAAAACAGATCGGAA11.3333333333333335No Hit
TATTAAGTACCAGTGGTGATATGTCACACAAGGAGATCGGAAGAGCACAC11.3333333333333335No Hit
AGCATGTCATACACCGTCAACGCAGCCCCCATGGTCGAGATCGGAAGAGC11.3333333333333335No Hit
GGCCAGCCGCAGCGCCCGGGATGTACCCACTTCCTCCAGCGCGGTGAGCA11.3333333333333335No Hit
AAAACGGAAAATAAAATCCAATAAATTCCAGTATGAGATCGGAAGAGCAC11.3333333333333335No Hit
ATTCAGCCTCATTGCGAAATTCCATCTTATTGAGCCGCAATTGAAGCAAA11.3333333333333335No Hit
CCCTCGTCCAGGAATCAGCCGAGGCACACAAAGATCGGAAGAGGACACGT11.3333333333333335No Hit
CGCCTCTGATATCTTTTTTTCATATAACCTAGATCATTAATTTTTACAGT11.3333333333333335No Hit
TTGCTTTTGTGTTTAGTTTGGTGGCGACAACCTGTAATTGGGCTCCGCCG11.3333333333333335No Hit
CGCAGGTGCTGCTCTACTCGTCGGCGGCGCTGTCGAGATCGGAAGAGCAC11.3333333333333335No Hit
AATCAAGAAGTTGCTTTGAAGGCAAAACAAGAAGAAGAGTCAAGTTGAGA11.3333333333333335No Hit
GCACACTGCCTAGAGAACCTAGCGGAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC11.3333333333333335Illumina Multiplexing PCR Primer 2.01 (100% over 25bp)
CGTCTACTCTTTTACCGACTTCGATCAGTCAGTTTGTTGAGTTATACACA11.3333333333333335No Hit
GTCTGTTTTCGCCGGAGAAGAGTTTGAAGAGTTCCAAGGAGATCGGAAGA11.3333333333333335No Hit
TGTGTAAATTTTGGACCTCTACACAAATTGAGGAAAGATAAGAACCAGAC11.3333333333333335No Hit
TTCTGCAGCCGTCAAAAAAAAACCTAGCTCGATTCCATGACCGGAAGGCA11.3333333333333335No Hit
GTAATTGTTGCTGTTAATTGTTAGGTTTTGGAGATCGGAAGAGCACACGT11.3333333333333335No Hit
CATTCCTGCATGTTCTAGCACTTGAATCAACAATAGTTTCAGATCGGAAG11.3333333333333335No Hit
ACGTAATTTCATAGAGTCATTCGATCTGAATGCTACATGAAGAACATAAG11.3333333333333335No Hit
TTGCAGTCAAACCAACAGTACAAGCGGAGTCAAAAGATCGGAAGAGCACA11.3333333333333335No Hit
CGAAATGGACGCCTTCCTCGCCGGAATCCCGCAGCTCCGCAGGCCGGCGG11.3333333333333335No Hit
TAGCGCCATCACACGGCCGGCTCGTACCACCCACAACATCGATCGATCTC11.3333333333333335No Hit
GGTGGCGTATGAGTCATGTTGATGTTTCTCCTTTTAGAAAAGATCGGAAG11.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)