FastQCFastQC Report
Sat 23 Nov 2024
000000000-GNC2B_l01_n01_run2_repeat_GyrBATH96.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-GNC2B_l01_n01_run2_repeat_GyrBATH96.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC61

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[FAIL]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AGAAAGAAAAGAAAAAAAGGGGAAAGGAGGGGGGGAAGGGGGAGGGGAAA16.666666666666667No Hit
AGGCCGGCTATGTACATAGGCGACACCGGCGACGGTTCCGGCCTCCACCA16.666666666666667No Hit
AGGCCCGGGATGTATATCGGTGATACCTCGGACGGCACCGGTCTGCATCA16.666666666666667No Hit
AGGCCTGGAATGTACATTGGCGGCACGGGCAAGGCGGGCCTGCACCACCT16.666666666666667No Hit
AGACCAGGAATGTATATTGGCAACACGGGTGAAGGAGGCGGGCAGCACCA16.666666666666667No Hit
AGACCGGGGATGTACATCGGCGACACCGACGATGGCACCGGCCTGCACCA16.666666666666667No Hit
AGGCCGGGGATGTACATCGGCGACACCGACGACGGATCAGGCCTGCACCA16.666666666666667No Hit
AGGCGTGGAATGTATATAGGCGGAAAGGAAGAAAAGGCGCTGCATCATCT16.666666666666667No Hit
AGGCCTGGAATGTACATCGGCGATATTCACGACGGCACCGGCCTGCACCA16.666666666666667No Hit
CGGCCGGGGATGTACATTGGCAACACGGACGACGGCTCCGGCCTGCACCA16.666666666666667No Hit
AGGGTTAATCGTGCCAAGAAAAGCGGCATGGTCAATATAACCAGTAGTGT16.666666666666667No Hit
AGGCCTGGAATGTACATTGGCGATACCGACGATGGCACCGGCCTGCACCA16.666666666666667No Hit
AGGCCAGGGATGTACATAGGCGACACCGACGACGGATCGGGCCTCCACCA16.666666666666667No Hit
CGGCCAGGGATGTATATCGGCGACACCGAAGACGGGTCGGGCCTCCACCA16.666666666666667No Hit
AGACCAGGAATGTATATTGGCGACACCGACGACGGCTCCGGCCTCCACCA16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)