FastQCFastQC Report
Sat 23 Nov 2024
000000000-GNC2B_l01_n01_run2_repeat_GyrBATH43.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-GNC2B_l01_n01_run2_repeat_GyrBATH43.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC64

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CGCCCCGGCATGTATATCGGCGATACTGACGACGGTTCGGGCCTGCACCA13.3333333333333335No Hit
CGTCCTGCAATGTATATTGGCTAGACCGGCGAGCGCCCCGTTCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
AGGCCAGGGATGTATATCGGCGACACCGGCGACAGCGGCGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
AGGCCTGCTATGTACATCGGTTCGCCGGGTCCCCGCGGTCTGCATCACCT13.3333333333333335No Hit
CGGCCCGGGATGTACATTGGCGACACGTCGGACGGCACCGGCCTGCACCA13.3333333333333335No Hit
AGACCCGGTATGTACATCGGCGACACCGATGACGGCTCGGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
AGTCCGGGGATGTATATCGGCTCCACCGGCGCACGCGGCCTGATGCATCG13.3333333333333335No Hit
CGTCCTGCCATGTATATAGGCGACACCTCCGACGCCACCGGCCTGCACCA13.3333333333333335No Hit
AGACCGGGGATGTACATTGGCTCCACGTGGGAGCGGGGCCTGCACCACCT13.3333333333333335No Hit
AGGCCGGCAATGTACATCGGCGACACCGACGACGGCACCGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
AGGCCAGGGATGTACATCGGCGACACCGACGATGGCTCGGGCCTGCATCA13.3333333333333335No Hit
CGGCCTGGGATGTACATCGGCTCGACGTCCGAGCGGGGGCTGCACCACCT13.3333333333333335No Hit
GGCTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTTGTAACAAGGTTTCTGTAGGTG13.3333333333333335No Hit
AGGCCGGGCATGTACATTGGCGACACCGACGACGGGTCCGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
AGGCCGGGCATGTATATCGGCGACACCGACGACGGCTCGGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
AGCCCGGGCATGTACATTGGCTCGACCGGCGAGCGCGGTCTGCACCACCT13.3333333333333335No Hit
AGGCCGGGGATGTACATTGGCAACACGGAGCACGGCGGGGGGCAGCACCA13.3333333333333335No Hit
CGTCCGGCCATGTACATTGGCGATACCGACGACGGATCGGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
CGGCCGGGTATGTACATTGGCGACACCTCCGACGGCACCGGCCTGCACCA13.3333333333333335No Hit
AGCCCAGGGATGCACATCGGCGGCACCGACGCGAAGGCGCTGCACCACTT13.3333333333333335No Hit
AGCCCCGCAATGTACATCGGGCGGCTTGGATGGCGTGGGCCGCTTATACA13.3333333333333335No Hit
AGACCTGGAATGTATATCGGGTCGACGGGCCTGCGCGGCCTGTACCACCT13.3333333333333335No Hit
AGCCCCGGTATGTATATAGGGTCCACCGGTGAGCGCGGTCTGCACCACCT13.3333333333333335No Hit
AGCCCAGGCATGTATATCGGCGCCACGGGGGAGCGCGGGCTGCATCACCT13.3333333333333335No Hit
AGGCCTGGAATGTACATAGGCGACACCGACGACGACTCGGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
AGTCCAGGAATGTACATTGGCGACACGGGTATCAAGGGCCTCCACCACCT13.3333333333333335No Hit
AGCCCGGGTATGTACATCGGCGACACCGACGACGGTTCAGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
AGGCCAGGAATGTATATTGGCGACACCGACGACGGATCGGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
CGCCCGGCAATGTATATAGGCGACACCGACGACGGGTCCGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
AGACCGGGGATGTACATCGGCTCGACCGGCGACCGCGCCCTCCACCACCT13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)