FastQCFastQC Report
Sat 23 Nov 2024
000000000-GNC2B_l01_n01_run2_repeat_GyrBATH18.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-GNC2B_l01_n01_run2_repeat_GyrBATH18.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC59

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTG26.666666666666667No Hit
AGTCCAGGTATGTACATCGGCTCCACCGGCCCGCGCGGCCTCCACCACCC13.3333333333333335No Hit
AGGCCAGCAATGTACATCGGGCGGCCTACATGGTGTCTGTCTCTTATACA13.3333333333333335No Hit
AGACCCGCAATGTACATCGGTTCCACCGGTGAGCGCGGCCTGCACCACCT13.3333333333333335No Hit
CGGCTGCGTTCTTCATCCGCGCCCACGAGACACGCTACTATCTCGTATGC13.3333333333333335No Hit
AGCCCCGGGATGTATATCGGCGACACCGACGACGGCTCGGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
CGGCCTGGCATGTATATCGGCGACACCGACGACGGGTCGCGCCTGCATCA13.3333333333333335No Hit
AGCCCTGGGATGTACATCGGCTCGACGGGGCCCCGGGGTCTTCATCACCT13.3333333333333335No Hit
AGACCAGCGATGTACATTGGCTCGACCGGCCCGCGTGGGCTCCACCACCT13.3333333333333335No Hit
AGGCCAGGGATGTACATTGGCGACACCGACGACGGCTCGGGCCTGCACCA13.3333333333333335No Hit
CGACCTGCCATGTATATCGGGCGGCCTACACGGCGTCTGTCTCTTATACA13.3333333333333335No Hit
AGGCCGGCTATGTACATAGGCGACACCGACGACGGTTCCGGCCTGCACCA13.3333333333333335No Hit
CGACCAGGAATGTATATCGGCGACACCGATGACGGCTCCGGTCTGCATCA13.3333333333333335No Hit
AGTCCGGCGATGTACATCGGCGACACCGACGACGGCTCGGGCCTGCACCA13.3333333333333335No Hit
CGCCCGGCAATGTACATCGGCGATACAGACGACGGTAGCGGTCTGCATCA13.3333333333333335No Hit
CGACCAGGTATGTACATTGGCGGCACCGACGAAAAGGCGATCCACCACCA13.3333333333333335No Hit
CGGCCCGGAATGTACATAGGCGACACCGACGACGGCTCGGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
GGCTTGGTCATTTAGAGGAAGTACGCAGCCGCTGTCTCTTATACACATCT13.3333333333333335No Hit
AGGCCCGGTATGTACATCGGCGACACCGACGACGGCTCGGGCCTCCACCA13.3333333333333335No Hit
AGGCCTGGGATGTATATAGGCGACACCGACGACGGGTCGGGCCTGCATCA13.3333333333333335No Hit
CGCCCAGCTATGTACATCGGCGACGTGGGCATTCGTGGACTACACCACCT13.3333333333333335No Hit
CGCCCAGGCATGTACATCGGCAACACCGACGACGGCTCGGGCCTGCACCA13.3333333333333335No Hit
AGGCCGGGTATGTATATCGGCTCGACCGGGGCGCGGGGCCTCCACCACCT13.3333333333333335No Hit
CGTCCGGCGATGTACATCGGCGACACCGACGACGGCTCGGGTCTGCACCA13.3333333333333335No Hit
CGACCCGGCATGTACATCGGCGACACTGACGACGGGTCGGGCCTGCATCA13.3333333333333335No Hit
AGACCGGGAATGTACATAGGCGACACCTCGGACGGCACGGGCCTGCACCA13.3333333333333335No Hit
AGTCCCGGCATGTATATTGGCGACACCGACGACGGGTCGGGCCTGCATCA13.3333333333333335No Hit
CGGCTGCGTTCTTCATCGATGCTCCGAGCCCACGAGACTGAGTACGATCT13.3333333333333335No Hit
AGGCCTGGAATGTATATCGGCGACACCGGCACGAAGGGCCTGCACCACCT13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)