FastQCFastQC Report
Tue 25 Jul 2023
000000000-GG345_l01_n02_Plate1Col5.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-GG345_l01_n02_Plate1Col5.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences60
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC40

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[WARN]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GATCCTCCACATATCGAACCCTCAATGAATGGCCGGGAAAGGTACACGCG2440.0No Hit
GCTCCTCCACATATCGAACCCTCAATGAATGGCCGGGAAAGGTACACGCG58.333333333333332No Hit
GATCCTCCACATATCGAACCAGATCTTGATTCAGGTAACCAAAAGCTAAC46.666666666666667No Hit
ATTACTCCCTTCAAATGAAAGTCTATACCACACATCTCAACTTACCCTTT11.6666666666666667No Hit
TTCACTTCTACTGGTTGGGTATTAAAGACAGAGTCCTCCTCCTATCTAAC11.6666666666666667No Hit
ACCGAAGAGGCGCATGGCTATGTGAGTATCAAAAAGACTGGAGACTCAAT11.6666666666666667No Hit
ATAATAGACACGGAAACCAAACTCTACACACAAACCTTTTTTATAGTAAC11.6666666666666667No Hit
ATTAATTGGGGGTAGATGAAGAATCCCCCCCCCAACCTCCCCCCAATAAA11.6666666666666667No Hit
TCAGGAGAGTCGCAATTTTTAAAATAACCACTAGCCTCCACACATCTAAC11.6666666666666667No Hit
TCCGGAGAGTGCCATGGGTTTATAAGCGCAAGGATACTCTCCCTCTGATA11.6666666666666667No Hit
ATGACCTGGGTAGAGACGAGAGTCTCCCCATAACACATCCTCCTAGAATT11.6666666666666667No Hit
AAAAAAATGTGAAAATAAGAGATCGGATCATCCAACTCTCAAACACTCAA11.6666666666666667No Hit
ATGGTGATCACGAAAACCGACACACCCCGACTTGAAACCTTCATCAAAGA11.6666666666666667No Hit
ACATGAATCTACACAACTAGAAACACACCTCAATAGACGGGAACGAACCA11.6666666666666667No Hit
ATTACTCTATTTGTGGGACGGTGATGGGGATAAGAGACAGGGCACCCGCA11.6666666666666667No Hit
CTTATATTCTGAAAAAGAAAAAAGCATCCCCATTACCAAACCACACTAGA11.6666666666666667No Hit
AATTTCTAAGCACATAGGAGGAGGAGTATCATAGAAAGGATGCTCTCCAA11.6666666666666667No Hit
GATCCTCCACATATCGCACCCTCAATGAATGGCCGGGAAAGGTACACGCG11.6666666666666667No Hit
ATTATAGGAGGAGGGACTCCATAATGGATAATAGAAACAGAACTCCACCT11.6666666666666667No Hit
GATCTCCACATATCGAACCCTCAATGAATGGCCGGGAAAGGTACACGCGT11.6666666666666667No Hit
ATAGTATTAGAAGGAACCAGGAATCCCCAATCAACCCCCCCAATATAATC11.6666666666666667No Hit
TTCGTAATATGAACGATCATAATATCACAACGATCCCTATCTTTATTTAT11.6666666666666667No Hit
AAAAACTTTGCGTTGTGTATTATTAAACGGATGCTCCTCATAACACACGA11.6666666666666667No Hit
GCTCCTACCCATATCGAACCCTCAATGAATGGCCGGGAAAGGTACACGCG11.6666666666666667No Hit
GATCCTCCACATATCGAACCCTCAATGAATGGCCGGGCAAGGTACACGCG11.6666666666666667No Hit
ATATAATTGTCTCGGATGTTTATTTGAGACAGGTTCCTCCTCATATATAA11.6666666666666667No Hit
ACCGAAGGGTCCCGTGGGTGCGGCAATTGACAGGAACTTCCCCCAAACGA11.6666666666666667No Hit
TATGAATATTCACATCTCATGTTCCCCTCAACCTACCCTCCTACTCCCTG11.6666666666666667No Hit
AAAAACTTTGTGTATATTAAAGAACAGGTACCCCCCATATCCAAACCCTC11.6666666666666667No Hit
TCAGGAGAGACGCGTCGGTTGCTCAGAGGCAAGATCCCGCACCTATATAA11.6666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)