FastQCFastQC Report
Mon 31 Jul 2023
000000000-GG345_l01_n01_Plate2Col4_mod.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-GG345_l01_n01_Plate2Col4_mod.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CGGGCACTAAGGCGTCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAA16.666666666666667No Hit
TAAACGCCAAGGCGTCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAA16.666666666666667No Hit
TATTTGGTGGTATCAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAACG16.666666666666667No Hit
CCGGAACGTTGATCGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGCTGGCGAAGGA16.666666666666667No Hit
AAAAGAATTTGATCGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAACG16.666666666666667No Hit
CGCTCTGTAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGAGCGCG16.666666666666667No Hit
CAATGGCGTTGATCGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAACG16.666666666666667No Hit
GTGGCGAATTGATCGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGCTGGCGAAGGA16.666666666666667No Hit
ACGGTGTTTTGATCGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAACG16.666666666666667No Hit
GACGACATTTGATCGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGCTGGCGAAGGA16.666666666666667No Hit
AATGTGAGTTGATCGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAACG16.666666666666667No Hit
GCAATTACGGTATCAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATCAGAAG16.666666666666667No Hit
AAAGTTGAGGTATCAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAACG16.666666666666667No Hit
TATGGTGTGGTATCAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAACG16.666666666666667No Hit
CAGTTCTAAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGAGCGCG16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)