FastQCFastQC Report
Tue 25 Jul 2023
000000000-GG345_l01_n01_Plate1Col5.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-GG345_l01_n01_Plate1Col5.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences60
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TATATCACAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
GGGCACAGCCTTAGTACTAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTT11.6666666666666667No Hit
TAGCGGAAGATGTCCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAAC11.6666666666666667No Hit
TGAGACGGGGTATCAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGAGCGCGAAGAA11.6666666666666667No Hit
GCAATTGTGATGTCCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAAC11.6666666666666667No Hit
CGAGTTAGAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
AGCTAGAGTTGATCGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAACG11.6666666666666667No Hit
ACGATATTAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
AAGTGGCTAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
TTCTTTCAAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATT11.6666666666666667No Hit
GTGGGATGGGTATCAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATCAGAAG11.6666666666666667No Hit
TTAACCTAAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGAGCGCG11.6666666666666667No Hit
TTTGCACGAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
TTATGCTGAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
TCTACACTGGTATCAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATCAGAAG11.6666666666666667No Hit
CCCCTGTCAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
CACCACGAGCATTGATAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGAGCGCGAAGA11.6666666666666667No Hit
TTAAGTGTCATTCTCGAGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATCAG11.6666666666666667No Hit
CGTTGTATAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
CTCGCTGAAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
CTCGTCAAAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
CCCGTTTAAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGAGTGGATC11.6666666666666667No Hit
TATAGGCTAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
GTACCCTCAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
TGCATTCTGCATTGATAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGAGCGCGAAGA11.6666666666666667No Hit
TCTAGAGTAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
GTTCTGGTGATGTCCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAAC11.6666666666666667No Hit
TACTTGTCGCATTGATAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAAC11.6666666666666667No Hit
GTGTCATAAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
GATGTCAAAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
AAAACTTTGATGTCCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAAC11.6666666666666667No Hit
CATCCGACAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
CTCGTTTGAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATT11.6666666666666667No Hit
CACGGATTAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
CTGCTTGATTGATCGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGAGCGCGAAGAA11.6666666666666667No Hit
TATTGAGAAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
GCAGGGTGGGTATCAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAACG11.6666666666666667No Hit
TCCTGTAACCTTAGTACTAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTT11.6666666666666667No Hit
GCTAACTAAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGAGCGCG11.6666666666666667No Hit
AGGCCTCGAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
ATTTCGTTAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
CTGCCTTAGATGTCCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAAC11.6666666666666667No Hit
AGCTATCTAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
GCATTTTTGGTATCAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAACG11.6666666666666667No Hit
GTTTTCGTGATGTCCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAAC11.6666666666666667No Hit
TTTTTTGAGGTATCAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATCAGAAG11.6666666666666667No Hit
AGACAACCAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
TTAATTGTAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
TGGCCTACAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
GGCGAGCTTTGATCGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGAGCGCGAAGAA11.6666666666666667No Hit
TCTCTCGGAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
ACTCTTAAAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
TTGCCTTAAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
CTGTGTTCAGTGGAATACCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATC11.6666666666666667No Hit
GCCTGATGGCATTGATAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGAGCGCGAAGA11.6666666666666667No Hit
GAGGTCGATTGATCGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGAGCGCGAAGAA11.6666666666666667No Hit
TGGGTTGTGGTATCAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGTGGATCAGAAG11.6666666666666667No Hit
TTGCACTCGGTATCAAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAACG11.6666666666666667No Hit
CTTAACACGATGTCCTAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGGGAATTTAAC11.6666666666666667No Hit
ATACGGACCATTCTCGAGAGTAAGTCCGTTCCTGAGCAAGCGAGCGCGAA11.6666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)