FastQCFastQC Report
Thu 23 May 2024
000000000-DP893_l01_n01_Kas-2_rep1_flg22.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-DP893_l01_n01_Kas-2_rep1_flg22.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences60
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCTTGTATGAGCTCAGGTCCGATCGTCTGGCCTCTCTCGATCTTCTGATC11.6666666666666667No Hit
GCCCGACGAGTGAAGCCAATCACTGATCGATCCATTCTCTGAATACTCGA11.6666666666666667No Hit
CTTCCCTCCGTCTTTACACCACTCTCTCCTCACTCTTCAGTATCATTCCA11.6666666666666667No Hit
ATTGCTTGAATAATCAATTTGAACAACACCGAGAAGACAAACCCAGAGAT11.6666666666666667No Hit
CTCTGTCTTCGTTTCTCCCTCAAACTCTCTCCCCACATCTTAGCCTCTGC11.6666666666666667No Hit
ACCAGATGCGCCTCTTGCTCCCTTATGACATCCTTCGACTTGACATAACT11.6666666666666667No Hit
CTCACGGTACTACTTCGCTATCGGTCACCCAGGAGTATTTAGCCTTGCAA11.6666666666666667No Hit
CATGAATGTATTGATTGATCTGCGATTGAGCTCCTTAAGAAGATGGCTGA11.6666666666666667No Hit
CACGCTTCAATTGTTGTGTTCTTCTTTACTAAACCCTAACTGTTAAGAAC11.6666666666666667No Hit
CTTCCCAAGCAATCTCATCGAAACCTTCATGTGGTTGTTTCTGACCAAAG11.6666666666666667No Hit
TCCTTATCCAACGCACATGCTTTAATAGCAGCATTGTATCGTCTACTTTC11.6666666666666667No Hit
AAAGGATATAATTTTGACGAACACACCAAAATTCAACTTAGTGATTAAAG11.6666666666666667No Hit
GGCAAGGATTGCAAAGGATAATTCTCCCAGTGGAGGAGTCTTAGCTCATA11.6666666666666667No Hit
CTTCCGTCTCTCTTCAGCTGAACCGCTTTTATTCCACCCGAGCGTCACGT11.6666666666666667No Hit
GTCCACACTCTGTTCTTGCGGTTTCTCCCAAGTATTCGGCAAGTCTAGCT11.6666666666666667No Hit
CCTCTGACTATGAAATACGAATGCCCCCGACTGTCCCTGTTAATCATTAC11.6666666666666667No Hit
CCGGAATCGAACCCTAATTCTCCGTCACCCGTTACCACCATGGTAGGCCA11.6666666666666667No Hit
TTGTCCTATATCTTCCCTACACTTCAAAATCTACAGCAGCTCATCCAAAC11.6666666666666667No Hit
TCCCAATCAACACACAATGGCAGCTCCTATTAAAGATTTTCAATCACCTC11.6666666666666667No Hit
GCCGTTGATTGTCGCGCGATAAACAGAGCCTTTGATTCTGTTTTCGTCGC11.6666666666666667No Hit
GTCAGAGGAGATAGACCTCAAGGTCTGAAGGTTCGCTGCGTCGCCTATAA11.6666666666666667No Hit
CCCGTATAGATAGACAAAAGTCGAGCATTAATAGGTTGATTTAAACACTC11.6666666666666667No Hit
ACGAATTGTAACACCTTTGACGAAGAGCCCTGACTTCCACAGTTGGCACT11.6666666666666667No Hit
TCACGATCAATATTATTTTCTAGGCTGCAGATTACTTCTTCCCATCCTTC11.6666666666666667No Hit
GTATTTGGGACGAATTGTAACACCTTTGACGAAGAGCCCTGACTTCCACA11.6666666666666667No Hit
CCCTAACCTTCCATGGAACTCCGCGTCTAACATAATGTTGGAAGCTTTGA11.6666666666666667No Hit
GCTCTTTTATCTTTTCAAACAGATACTCTTTCTCTGCCTCCGCCTCGCTC11.6666666666666667No Hit
CCCAACTGAATCATCGGTACCGCCGGTATAGCAACGTATGTAATCCCGGC11.6666666666666667No Hit
GTCTTGGAACTGAAGAACTTAGATCTTATTGAGATTAATTCTCGTACTGC11.6666666666666667No Hit
CTCCATCTTCCTCCATTGCCTCTGGGTTCTCGCTCCTCCTCTTCTCCTTT11.6666666666666667No Hit
CGGTAATGCAAGAAGAGACAAAGGATAACAAGCCGCAGCATAATAACCAT11.6666666666666667No Hit
GCTTCCACGGAAAATCCTACTAACGAAGTCAAGTTCCTTCATTAAAGATT11.6666666666666667No Hit
CTCTGTAACTTGGCACTTGTCAGGACGTCTCGTGAAGTGAACCACCGAAC11.6666666666666667No Hit
GCCTCATCGTCCCTAAAAGACAGTGATTAATAATAGTATCATTACAGAAT11.6666666666666667No Hit
CCACACTCAATAATCTTGTCATCGCCGAAATCGCAGCTGAACTCAAATAT11.6666666666666667No Hit
GCTCCGTAGTTTGACTACATGTGCGTAGTGAACAACATCCTCACCGTTCA11.6666666666666667No Hit
CTGTAGTCCAATAATTGAAGTTTTTTTCTAGCCGATGTGAGACACATTCC11.6666666666666667No Hit
CGCTTCTAAGGGCTCGGAGGGAGAGAATCACGAACCTAATCGTCGAGCCA11.6666666666666667No Hit
CCTCCTCTCCTGAAACGGCAGTTTCTTAACTCTGGGGCAATTTGTGATGA11.6666666666666667No Hit
GTATTCCTTCGACTTCTGACGGATATTCACCATATGCAAGTGACGCTGGA11.6666666666666667No Hit
CCCAAGCAATCTCATCGAAACCTTCATGTGGTTGTTTCTGACCAAAGGCA11.6666666666666667No Hit
CCCGCCCAAATCATTCCATATCTCTTTATCAACAATCTCATCAAACTCAC11.6666666666666667No Hit
GCCCCTTCAAGTACCTTGACTCGTACAATTCCTCAGGGAAAGAGGATTCA11.6666666666666667No Hit
CTCCTGTTCCTTGGCTTCAGCTATGTCCCTCGCATCAGTGGACTCACGTT11.6666666666666667No Hit
CACTCCAAAAATAGACAAAACATTCCTACTTCTAAGCCACAATCACATCT11.6666666666666667No Hit
GTCGTCGAGGATACGGCGCGTGGGACGTTCGTAGAGGTCGGAGCTTGCGC11.6666666666666667No Hit
GCACTTGCATCTTACAGATAAACGGTTGGCATGATGACCTTCATTATCAT11.6666666666666667No Hit
TGGGATTCTGGTGGTGGCTGTGGGGAGGTTGTTGATTGATTGGATCTCTG11.6666666666666667No Hit
CACTGTACAGTCTGAGAAGTGTTCTCTTAGCGTTTTCTGAATCAGATTGT11.6666666666666667No Hit
CTCAAAATCCAAAAAACCTGACATAAAAAAATCTCGTGTACTATTTAATC11.6666666666666667No Hit
GCTGACTCTTTATTTTCGTTATCCTCTCATTGATCTCTTGCAAACGTTTG11.6666666666666667No Hit
AACATCGGAAGCTTGTGAGGACTCAACCACGATGGACTCGACTTTCCAGG11.6666666666666667No Hit
GTTTCTTAAACTGTTCAGCGAGTACTCCGGTCTGCCACCTCACATGATTC11.6666666666666667No Hit
CACTCATCTTGGGACGTGCCTTTGAGTTCCTAACCAAACATCTGTTGGCC11.6666666666666667No Hit
GCACGCCTCCGTTACCTTTTGGGAGGCCTACGCCCCATAGAAACTGTCTA11.6666666666666667No Hit
CGCTGCGGCTGCTGATGATGCTGAGCTAGGGGTTGATGGAGGAACCGGGT11.6666666666666667No Hit
CGACGTTTTTCTTCGATGTGGTGAACTCTCCAACTGGAATATCGAGCCAT11.6666666666666667No Hit
TTCTCATTCTCCTTCGAACGTTTTGCTAGTCGTGGTGGAAGTTTCTTAGA11.6666666666666667No Hit
CCCCTCTCCTCTTGTTCGTCTATAAACACGTTGATCTTTTCTTTTTTCAA11.6666666666666667No Hit
GTATCCTCTTGCCCAAATCCCAACCACTCTCAAACTTTTGTTGGAATTCA11.6666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)