FastQCFastQC Report
Sat 25 Mar 2023
000000000-DKV2Y_l01_n01_F09_ATH.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filename000000000-DKV2Y_l01_n01_F09_ATH.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC39

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CACTATTCTGTGCGATGACACTATCAATGCTGCTTGATTTAGCTGCTGGA16.666666666666667No Hit
GAATACAGCACATAGAGCTATCCCAGAAAGGTTCTTGTCATGCCAATGTG16.666666666666667No Hit
ATTTATATCATTCGTTGGTGCTGCTAACTCCCCTTGAGGTAACTGGATAA16.666666666666667No Hit
GATTTTATTAAACGTAACTTCATTGTTATATATGCAAACATGATATTTGA16.666666666666667No Hit
GACTTGCTCTAACTAACCATTTCCGGGAGAAAAGTAAATTTGTGTTTTTG16.666666666666667No Hit
TGTCTCCGCTCATTACCAAACCTGAAACGAATCAGACTGGAGCAAGTTTC16.666666666666667No Hit
ATCAAAGCCAAAAATCTCTCCTTTTTTGACAGCTGTTTGACTTTTTTTTT16.666666666666667No Hit
GGACGAGCTGTCCTTTAGCTCTAGCTTCGTACTATCTCGAGAACGGAACA16.666666666666667No Hit
GGGTTCATCTTTGCGTGGGGAGAGCAAGCAAGAGTGGGAACTTCAATTGT16.666666666666667No Hit
GAAGGAACCATTTAATCGCCTCAGCGGAATACATATACTAGGCACAATAC16.666666666666667No Hit
CAATATAGCAAACATATTTTGACATCCTCCCCTTTGAGACTATCATAGCT16.666666666666667No Hit
GGTCAGGATAGCAGATGCATAGCCATAACTATCGTGTTTCAGTTCCGTTA16.666666666666667No Hit
CTGCAAGAGTGGTTTTACCAATCCCAGGCATCCCAACAATTCCAACAGTT16.666666666666667No Hit
TCACTGTGTTCAATCTCATTAACAAGTCCTTGAAGAGGTGTATACCCTAT16.666666666666667No Hit
ATTGAAGGATCACAAGCAATCGATTACTAAAGGATGACAAGTAAGAAGAC16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)