Sample	FastQC_percent_duplicates	FastQC_percent_gc	FastQC_avg_sequence_length	FastQC_total_sequences	FastQC_percent_fails
000000000-CHT9C_l01_n01_10_d5_NW_RC1_F2_CA_7_09_6386_1	90.2420145292	43.0	151.0	456047.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_10_d5_NW_RC1_F2_CA_7_09_6386_2	88.166319454	44.0	151.0	326889.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_11_dA1_NW_RC1_F2_CA_7_09_6390_1	89.2471780286	44.0	151.0	393785.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_11_dA1_NW_RC1_F2_CA_7_09_6390_2	87.8827081942	44.0	151.0	330833.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_12_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6363_1	89.4416151328	44.0	151.0	340876.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_12_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6363_2	88.9979581497	44.0	151.0	325685.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_13_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6366_1	90.1733111739	44.0	151.0	401936.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_13_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6366_2	88.2982632676	44.0	151.0	291179.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_14_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6384_1	87.9666627261	44.0	151.0	422950.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_14_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6384_2	87.2454936875	45.0	151.0	383684.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_15_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6388_1	89.6150468051	43.0	151.0	439482.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_15_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6388_2	87.0717186587	44.0	151.0	292769.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_16_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6391_1	89.0026278553	44.0	151.0	371025.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_16_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6391_2	87.9566525026	44.0	151.0	289936.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_1_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_5456_1	89.6732427811	43.0	151.0	478398.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_1_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_5456_2	87.6375567542	44.0	151.0	285882.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_2_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6361_1	88.9041614901	43.0	151.0	453972.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_2_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6361_2	88.137949295	44.0	151.0	377675.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_3_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6364_1	90.035117068	44.0	151.0	451917.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_3_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6364_2	86.4027724929	44.0	151.0	268062.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_4_d2_NW_D1_F1_CA_7_09_6382_1	89.1076582656	44.0	151.0	390467.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_4_d2_NW_D1_F1_CA_7_09_6382_2	88.9352926433	44.0	151.0	367068.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_5_2016_TS_FT_02_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6385_1	89.4623430569	44.0	151.0	372189.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_5_2016_TS_FT_02_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6385_2	77.1734909989	44.0	151.0	113320.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_6_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6389_1	87.8697927464	44.0	151.0	318354.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_6_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6389_2	89.0763178443	44.0	151.0	400863.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_7_dA1_NW_RC1_F2_CA_7_09_6362_1	87.380136236	43.0	151.0	296691.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_7_dA1_NW_RC1_F2_CA_7_09_6362_2	88.7040587114	44.0	151.0	376622.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_8_dA1_NW_RC1_F2_CA_7_09_6365_1	88.8610311312	44.0	151.0	462269.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_8_dA1_NW_RC1_F2_CA_7_09_6365_2	85.0266791169	45.0	151.0	299860.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_9_d5_NW_RC1_F2_CA_7_09_6383_1	90.0402934669	43.0	151.0	429350.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_9_d5_NW_RC1_F2_CA_7_09_6383_2	89.8146642422	44.0	151.0	405858.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_A_Harbor_Seal_New_Hampshire_179629_2012_H3N8_1	90.4119449102	45.0	151.0	455692.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_A_Harbor_Seal_New_Hampshire_179629_2012_H3N8_2	89.9426597617	43.0	151.0	392569.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_A_Texas_50_2012_1	90.0391456046	44.0	151.0	446538.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_A_Texas_50_2012_2	89.8328869404	43.0	151.0	413313.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_BLANK_1	56.78282514	48.0	151.0	3214.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_BLANK_2	1.80722891566	45.0	151.0	166.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_NEGATIVE_1	56.5095729013	42.0	151.0	6790.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_NEGATIVE_2	2.95857988166	46.0	151.0	169.0	41.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_PD7_PB2_04_1	95.4459792437	44.0	151.0	383112.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_PD7_PB2_04_2	95.8521423288	43.0	151.0	421784.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_PD7_PB2_4_1	95.9053138114	43.0	151.0	419153.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_PD7_PB2_4_2	94.4836347487	43.0	151.0	290463.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n01_pH1N1_p002_1	89.4642528524	45.0	151.0	434720.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n01_pH1N1_p002_2	88.6361209584	44.0	151.0	374608.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n01_undetermined	88.637671241	48.0	151.0	967833.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n02_10_d5_NW_RC1_F2_CA_7_09_6386_1	87.8791001805	43.0	151.0	456047.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_10_d5_NW_RC1_F2_CA_7_09_6386_2	86.5608815225	44.0	151.0	326889.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_11_dA1_NW_RC1_F2_CA_7_09_6390_1	85.8615742093	44.0	151.0	393785.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_11_dA1_NW_RC1_F2_CA_7_09_6390_2	84.7058787969	44.0	151.0	330833.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_12_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6363_1	86.4974360178	44.0	151.0	340876.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_12_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6363_2	86.5784423599	44.0	151.0	325685.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_13_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6366_1	86.3202101827	44.0	151.0	401936.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_13_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6366_2	82.887158758	44.0	151.0	291179.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_14_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6384_1	86.6241872562	44.0	151.0	422950.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_14_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6384_2	86.0609251363	45.0	151.0	383684.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_15_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6388_1	86.8276743985	43.0	151.0	439482.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_15_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6388_2	85.3973610594	44.0	151.0	292769.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_16_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6391_1	84.2598207668	44.0	151.0	371025.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n02_16_dA3_NW_RC2_F3_CA_7_09_6391_2	84.3396473705	44.0	151.0	289936.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_1_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_5456_1	87.4880329767	43.0	151.0	478398.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_1_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_5456_2	85.2624509413	44.0	151.0	285882.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_2_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6361_1	86.9648348356	43.0	151.0	453972.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_2_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6361_2	86.5090355464	44.0	151.0	377675.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_3_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6364_1	87.1761850074	44.0	151.0	451917.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_3_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6364_2	82.2272459356	44.0	151.0	268062.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_4_d2_NW_D1_F1_CA_7_09_6382_1	86.6201241078	44.0	151.0	390467.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_4_d2_NW_D1_F1_CA_7_09_6382_2	87.0746019811	44.0	151.0	367068.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_5_2016_TS_FT_02_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6385_1	86.8964423989	44.0	151.0	372189.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_5_2016_TS_FT_02_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6385_2	58.6992587363	44.0	151.0	113320.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n02_6_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6389_1	87.0345590129	44.0	151.0	318354.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n02_6_d2_NW_DI_F1_CA_7_09_6389_2	88.17351564	44.0	151.0	400863.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_7_dA1_NW_RC1_F2_CA_7_09_6362_1	85.0986379769	43.0	151.0	296691.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_7_dA1_NW_RC1_F2_CA_7_09_6362_2	87.1956497496	44.0	151.0	376622.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_8_dA1_NW_RC1_F2_CA_7_09_6365_1	86.0905663153	44.0	151.0	462269.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_8_dA1_NW_RC1_F2_CA_7_09_6365_2	83.232175015	45.0	151.0	299860.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_9_d5_NW_RC1_F2_CA_7_09_6383_1	87.3893094212	43.0	151.0	429350.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n02_9_d5_NW_RC1_F2_CA_7_09_6383_2	87.587037831	44.0	151.0	405858.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_A_Harbor_Seal_New_Hampshire_179629_2012_H3N8_1	86.1873809503	45.0	151.0	455692.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n02_A_Harbor_Seal_New_Hampshire_179629_2012_H3N8_2	87.9875894429	43.0	151.0	392569.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n02_A_Texas_50_2012_1	84.9320774492	44.0	151.0	446538.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n02_A_Texas_50_2012_2	87.4978527169	43.0	151.0	413313.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n02_BLANK_1	50.4667081518	49.0	151.0	3214.0	41.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_BLANK_2	0.602409638554	44.0	151.0	166.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n02_NEGATIVE_1	51.9440353461	42.0	151.0	6790.0	33.3333333333
000000000-CHT9C_l01_n02_NEGATIVE_2	0.591715976331	44.0	151.0	169.0	41.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_PD7_PB2_04_1	90.2892626699	44.0	151.0	383112.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_PD7_PB2_04_2	94.5739999621	43.0	151.0	421784.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_PD7_PB2_4_1	91.8459369252	43.0	151.0	419153.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_PD7_PB2_4_2	94.1114703078	43.0	151.0	290463.0	16.6666666667
000000000-CHT9C_l01_n02_pH1N1_p002_1	84.8463378727	45.0	151.0	434720.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n02_pH1N1_p002_2	86.8131486781	44.0	151.0	374608.0	25.0
000000000-CHT9C_l01_n02_undetermined	79.1699228869	45.0	151.0	967833.0	8.33333333333